普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈明丽

作者： 陈明丽;王兰芬;武晶;张晓艳;杨广东;王述民

作者机构：

关键词： 普通菜豆;豇豆属;SSR 标记;通用性

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2014 年 40 卷 5 期

页码： 924-933

收录情况： CSCD

摘要： 分子标记具种属间通用性可提高其利用效率, 并降低标记开发成本。本研究基于Roche 454超高通量测序技术获得普通菜豆基因组测序结果, 共开发了560个普通菜豆基因组SSR 标记。利用2份普通菜豆品种对标记进行初步筛选, 有421个标记能够有效扩增。用新开发的标记分析16份豇豆和16份小豆的通用性。结果显示, 185个普通菜豆基因组SSR 标记在豇豆中能有效扩增, 通用性比率为43.9%; 161个SSR 标记在小豆中能有效扩增, 通用性比率为38.2%;在豇豆和小豆中都能获得有效扩增条带的标记共138个; 并且普通菜豆基因序列SSR 标记在豇豆和小豆中的通用性比率高于基因间序列SSR 标记。通用性标记的多态性分析表明, 豇豆和小豆的多态性比率分别为34.0%和24.8%; 且豇豆和小豆中基因间标记的多态性都比基因内标记的多态性高。上述通用性标记为豇豆属作物的多样性评价、连锁图谱的构建及基因定位等方面的研究提供了便利。

分类号：

  • 相关文献

[1]普通菜豆基因组SSR标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析. 陈明丽,王兰芬,武晶,张晓艳,杨广东,王述民. 2014

[2]绿豆基因组SSR引物在豇豆属作物中的通用性. 钟敏,程须珍,王丽侠,王素华,王小宝. 2012

[3]小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR 分析. 白鹏,程须珍,王丽侠,王素华,陈红霖. 2014

[4]中国黄瓜主栽品种SSR 遗传多样性分析及指纹图谱构建. 苗晗,张圣平,顾兴芳,王烨,陈磊. 2014

[5]国内外甜高梁种质遗传多样性的SSR分析. 赵香娜,岳美琪,刘洋,顿宝庆,赵伟华,谭亮,李桂英. 2010

[6]基于 SSR 和 ISSR 的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析. 王惠梅,吴国林,江绍琳,黄奇娜,奉保华,黄长干,江绍玫,吴建利. 2015

[7]黄瓜成熟瓜网纹基因H 遗传定位及候选基因分析. 王敏,顾兴芳,苗晗,刘书林,王烨,Wehner Todd C,张圣平. 2014

[8]豇豆属的分类历史与现状. 陈一舞,林黎奋. 1992

[9]豇豆属食用豆类间的远缘杂交. 刘长友,范保杰,曹志敏,苏秋竹,王彦,张志肖,程须珍,田静. 2015

[10]豇豆属3种主要食用豆类的抗豆象育种研究进展. 刘长友,田静,范保杰,曹志敏,苏秋竹,张志肖,王素华. 2010

[11]小豆远缘杂交研究进展. 徐宁,王明海,包淑英,王桂芳,郭中校. 2010

[12]豇豆属内栽培种分类的再研究. 陈一舞,林黎奋,高吉寅. 1992

[13]广西主要的4种食用豆对绿豆象抗性研究初探. 江洪平,廖张波. 2022

[14]豇豆属野生近缘种资源研究进展. 王丽侠,陈新,王素华,袁星星,陈红霖,程须珍. 2020

[15]藜麦EST-SSR的开发及通用性分析. 张体付,戚维聪,顾闽峰,张晓林,李坦,赵涵. 2016

[16]马铃薯SSR标记在茄子上的通用性分析. 陈孟强,张娅,庄泽彬,张叶,牛玉,汪国平. 2013

[17]小麦微卫星标记在中间偃麦草中通用性研究. 王黎明,李兴锋,刘树兵,王洪刚. 2007

[18]辣椒EST-SSRs标记的通用性研究. 李永平,陈敏氡,康建坂,温庆放. 2017

[19]近缘属SSR标记引物在光萼荷属植物中的通用性. 王炜勇,俞少华,张飞,沈晓岚,葛亚英,俞信英,张智,郁永明. 2013

[20]育苗移栽机具的发展现状及趋势. 王帅. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序