西红花实时荧光定量PCR内参基因筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周琳

作者： 周琳;蔡友铭;杨柳燕;赵冰雪;李芳;张永春

作者机构：

关键词： 西红花(Crocus sativus);不同组织;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 022 期

页码： 7467-7475

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选西红花不同组织间稳定表达的最佳内参基因,以西红花的根、球茎、主芽、花丝、叶片、侧芽共6个组织为试验材料,运用实时荧光定量PCR方法分析了18S核糖体RNA (18S rRNA)、肌动蛋白基因(ACT)、转录延伸因子-1α (EF1α)、3-磷酸-甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、微管蛋白基因(TUB)和多聚泛素基因(UBQ)共6个内参基因在不同组织中的表达差异情况.基于Ct值,利用geNorm、NormFinder和Best-Keeper分析6个内参基因表达稳定性.结果 表明,3个软件筛选出的最佳内参基因略有不同.综合分析结果显示,GAPDH和UBQ表达较为稳定,其次为18S rRNA和ACT,而EF1α和TUB不适合作为西红花不同组织的内参基因.本研究确定西红花qRT-PCR分析的合适内参基因为GA PDH和UBQ,可用于种球发育、花发育、次生代谢产物形成和积累等机理研究.

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