基于转录组测序的茄子萼下果色光敏相关基因表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 乔军
作者: 乔军;王利英;刘婧;李素文
作者机构:
关键词: 茄子;转录组测序;萼下果色;光敏;基因表达
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2022 年 49 卷 011 期
页码: 2347-2356
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了探究茄子光敏品种和非光敏品种控制萼下果色的差异基因,以萼下紫色的圆茄自交系Y5和萼下绿色的圆茄自交系Y73萼片下果皮为试材,进行去萼片见光0、4和8 h的转录组测序.共获得75.61Gb有效数据(Clean data),Q30碱基百分比均达到93.97%以上;两个自交系材料在3个时间点的转录组测序比较共获得11 812个差异表达基因,包括5 277个上调基因和6 535个下调基因.3个时间点数据KEGG富集分析同时指向苯丙烷生物合成、类黄酮生物合成和光合生物的固碳作用通路.苯丙烷和类黄酮生物合成路径中共同差异表达的基因有4个,分别是FAOMT、CCOAOMT、CYP73A4和HST.筛选出了与花青素合成相关结构基因CHI、ANS、F3H、PAL以及转录因子基因MYB113在萼下果皮表达差异显著.
分类号: S641.1
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