鸭圆环病毒ORF-C1基因的扩增及遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 吕振环

作者: 吕振环;赵莎;卢凤英;杨婧;韩凯凯;黄欣梅;赵冬敏;章丽娇;吴凤瑶;刘宇卓;李银;刘青涛;张小飞

作者机构:

关键词: 鸭圆环病毒;ORF-C1基因;遗传进化分析

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2023 年 55 卷 005 期

页码: 63-69

收录情况: 北大核心

摘要: 鸭圆环病毒(DuCV)感染能够引起鸭的免疫抑制,引起多种病原的继发性感染,在我国鸭群中广泛流行.为了解DuCV的遗传变异情况,对采自山东、江苏和贵州3个省份的19个鸭场的样品进行了 PCR测定,并对DuCV的ORF-C1基因进行测序和遗传进化分析.PCR测定结果显示,19个鸭场中有9个鸭场的样品为DuCV阳性,总体阳性率为47.4%;ORF-C1基因序列测定结果显示,9株DuCV之间的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为93.4%~100%和82.2%~100%,与NCBI中已公布的DuCV毒株的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为77.8%~99.5%和71.5%~-99.6%;遗传进化分析显示,9株DuCV全部属于DuCV-1b亚型,其中有7株在同一分支上,与D11-JW-001等韩国毒株遗传距离较近,另外2株则与山东、广西的毒株遗传距离较近;此外,与已公布的毒株相比,9株DuCV都在158位发生了氨基酸突变,由E/D变为L/P.上述结果表明,DuCV-1仍然为我国鸭群中的优势流行基因型,但病毒的基因也在不断地发生变异,应该对其进行持续监测.

分类号: S852.65

  • 相关文献

[1]鸭圆环病毒全基因组克隆与序列分析. 傅光华,程龙飞,施少华,彭春香,陈红梅,黄瑜. 2008

[2]应用巢式PCR检测鸭圆环病毒浙江株及其全基因序列分析. 万春和,施少华,程龙飞,傅光华,陈红梅,黄瑜. 2009

[3]鸭圆环病毒感染的临床症状. 黄瑜,万春和,彭春香,傅光华,施少华,陈红梅,程龙飞,傅秋玲. 2013

[4]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010

[5]分子标记株鸭圆环病毒感染性核酸的构建. 万春和,傅光华,施少华,程龙飞,陈红梅,黄瑜. 2010

[6]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[7]鸭圆环病毒基因Ⅰ型和Ⅱ型PCR-RFLP鉴别诊断方法的建立. 万春和,程龙飞,傅光华,施少华,陈红梅,傅秋玲,刘荣昌,黄瑜. 2016

[8]鸭圆环病毒感染的检测. 施少华,万春和,陈珍,傅光华,江斌. 2010

[9]半番鸭共感染鸭圆环病毒和新型番鸭细小病毒的诊断. 张瑞,刘荣昌,黄瑜. 2020

[10]鸭坦布苏病毒病、鸭圆环病毒病与鸭疫里默氏杆菌混合感染的诊断. 李婷,徐景峨,杨莉,蒲龄,张亚楠,余波,韩雪,赵滨,杨粤黔. 2020

[11]鸭圆环病毒和鹅圆环病毒三引物鉴别检测方法的建立. 王梦鸽,黄瑜,傅秋玲,程龙飞,万春和,刘荣昌,陈红梅,江南松,梁齐章,施少华,林建生,傅光华. 2023

[12]牛支原体湖北株的分离鉴定及其oppF基因的进化分析. 刘威,袁芳艳,周丹娜,刘泽文,杨克礼,段正赢,郭锐,吴修竹,田永祥. 2016

[13]猪嵴病毒福建株3D基因的克隆及遗传进化分析. 陈如敬,吴学敏,车勇良,王隆柏,魏宏,庄向生,刘玉涛,严山,周伦江. 2012

[14]猪源绿色气球菌的分离鉴定及16S rRNA基因序列测定与遗传进化分析. 张乐宜,李艳,蔡汝健,刘燕玲,蒋智勇,宋长绪. 2014

[15]棉红铃虫种群遗传和入侵来源的核DNA研究. 吴孔明,郭予元. 2007

[16]2014.08-2015.06我国猪瘟病毒(CSFV)分子流行病学分析. 张洪亮,冯丽苹,冷超粮,陈家锃,刘春晓,白云,王倩,安同庆,彭金美,蔡雪辉,田志军,童光志. 2015

[17]蛋源摩氏摩根菌分离、鉴定及遗传进化分析. 于恩琪,张笛,李东明,杨振,宰栩生,龚建森,秦爱建,金文杰. 2013

[18]猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离及其基因组变异特征的研究. 王青,徐彦召,王磊,张慧辉,张文举. 2016

[19]羊口疮病毒湖北株B2L基因的克隆与遗传进化分析. 郭锐,田永祥,周丹娜,段正赢,杨克礼. 2017

[20]山东新城疫病毒分离株F基因的遗传进化分析. 苏文政,韩红,朱荣生. 2010

作者其他论文 更多>>