利用转录组挖掘羊肚菌继代菌丝退化相关基因的初步探讨

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐爱国

作者： 徐爱国;储婷;杨瑞恒;李福后;张建;唐利华

作者机构：

关键词： 羊肚菌;菌丝;继代;退化;转录组

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2023 年 30 卷 001 期

页码： 10-16

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 继代培养7代羊肚菌(Morchella esculenta)菌丝体,计算不同代数的菌丝生长速度,再分别收集第一代(M 1)和第六代(M 6)菌丝体,通过转录组测序,GO功能注释和富集与KEGG通路富集,得到关键差异基因,最后选取7个与退化相关的关键差异基因cel1、lac2、cah、png1、zpr1、did2和Hsp31,采用荧光定量PCR测定基因相对表达量,以验证转录组分析结果的可靠性.结果表明:当继代培养至第7代时,羊肚菌菌丝不能生长;M 6与M 1相比,共得到575个关键差异基因,其中表达上调198个,表达下调377个;GO富集表明,关键差异基因主要富集在活性氮代谢过程、硝酸盐代谢过程、硝酸盐同化和从头合成次黄嘌呤核苷酸的生物过程;KEGG通路富集表明,关键差异基因主要富集在磷酸戊糖途径、泛酸和乙酰辅酶A生物合成、硒化合物代谢、生物素代谢和精氨酸生物合成通路;7个关键差异基因的相对表达量与转录组测序分析结果一致.

分类号： S646.7

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