上海地区猪萨佩罗病毒的检测及遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李本强
作者: 李本强;刘惠莉;刘佳佳;陶洁;程靖华;石迎;乔长涛;沈晓晖
作者机构:
关键词: 猪萨佩罗病毒分离株;流行病学调查;VP1基因;遗传进化分析
期刊名称: 上海农业学报
ISSN: 1000-3924
年卷期: 2023 年 39 卷 002 期
页码: 64-70
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了明确猪萨佩罗病毒在仔猪腹泻病情中的作用,2016-2020 年采集上海市及周边 11 个猪场腹泻病料,共计1446 份.利用RT-PCR方法对其进行PSV筛检,并对阳性样品进行病原分离及病毒特性研究.结果显示:共筛检出256 份PSV核酸阳性样品,阳性率17.7%.从阳性样品中成功分离到2 株PSV病毒,全基因序列遗传进化分析显示2 株PSV分离株聚集在中国PSV毒株集群上,分离株在3D区域4696-5945 bp处存在重组区域.病毒核苷酸分析发现中国PSV毒株与韩国PSV毒株核苷酸相似性为 87%—88.5%,与欧洲PSV毒株核苷酸相似性为84.9%—87.3%.对VP1 基因氨基酸序列分析发现分离株与参考株存在氨基酸位点突变,中间氨基酸序列保守,无突变及插入和缺少现象.PSV分离株与参考株均含有173 位潜在糖基化位点,VP1 蛋白分子表面抗原表位分布均匀.该研究可为猪萨佩罗病毒病原学及其疫苗的研制奠定基础.
分类号: S852.651
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