不同繁殖力绵羊卵巢转录组比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘在霞

作者： 刘在霞;刘永斌;石彩霞;谷明娟;满达;王宇;付绍印;何小龙;戴伶俐;白音巴图;鲍艳春;张文广;娜日苏

作者机构：

关键词： 绵羊;产羔数;繁殖;繁殖基因

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2023 年 012 期

页码： 132-143

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入探索影响绵羊繁殖力的分子调控机制，本研究对16个产多羔的高繁绵羊和产单羔的低繁绵羊的卵巢转录组数据进行分析，使用WGCNA和eGWAS构建绵羊卵巢加权基因共表达网络和基于表达的全基因组关联，使用DESeq2进行差异基因分析，并通过EWSS挖掘繁殖高分化基因。结果表明：1)高繁绵羊和低繁绵羊卵巢组织共表达26 747个基因。2)17 908个高变异基因被聚为9个共表达基因模块。3)884个差异表达基因中高繁绵羊的上调表达基因多于低繁绵羊。4)获得28 727个高质量的SNPs变异位点，筛选到232个极高度变异的SNPs。5)通过多种方法整合筛选到12个影响绵羊繁殖力高度分化的基因（FGD4、LHFPL2、PPIL6、MILR1、PPP1R9B、NUP62、POU2F3、PHLDB1、SH3PXD2B、XPC、DAXX和MXRA5）。综上，本研究揭示了绵羊卵巢基因的表达模式及多维度筛选的绵羊繁殖力差异基因，最终找到12个可能调控绵羊繁殖相关的关键基因，为绵羊繁殖研究提供理论依据和数据支撑。

分类号： S826

  • 相关文献

[1]3个绵羊群体BMPR-IB基因多态性与产羔数的相关分析. 刘猛,柳晓晓,王金文,曲绪仙,陈华,李晶,柳楠. 2008

[2]GDF9和FecB基因在两种绵羊杂种中的多态性及其产羔数和体重相关性分析. 杨博辉,刘建斌,郭健,郎侠,程胜利,孙晓萍. 2008

[3]两种绵羊杂种GDF9基因和FecB基因的多态性及其与产羔数和体重关系的研究. 于佐卿,杨博辉,郭健,郎侠,刘建斌,程胜利,孙晓萍. 2008

[4]巴美肉羊发情期血清FSH和LH浓度变化规律及其与产羔数关系分析. 祁云霞,何小龙,刘晓芳,吴江鸿,荣威恒,刘永斌. 2014

[5]绵羊抑制素β_A基因多态性及其与产羔数关系的研究. 庄海滨,储明星,李学伟,方丽,叶素成. 2007

[6]中国美利奴羊多胎品系选育中多胎性状分离与BMPR-IB基因型的相关性分析. 杨华,张永胜,何其宏,王建华,杨永林,钟发刚,王新华,刘守仁. 2009

[7]FecB基因在9个绵羊品种中的多态性及其与产羔数和羔羊生长发育的相关性(英文). 管峰,刘守仁,石国庆,艾君涛,茆达干,杨利国. 2006

[8]绵羊BMPR-IB基因单核苷酸多态性分析. 杨华,杨永林,刘守仁,钟发刚,张永胜,何其宏. 2010

[9]BMPR-IB基因和FSHβ基因多态性及其与小尾寒羊产羔数关联性分析. 刘建斌,郎侠,杨博辉,郭健,孙晓萍,程胜利. 2010

[10]绵羊产羔性状主效基因检测研究. 王启贵,钟发刚,李辉,王新华,刘守仁,陈晓军,甘尚泉. 2005

[11]绵羊BMP-RIB基因多态性及其与中国美利奴肉用多胎品系产羔数和生长发育的相关性. 管峰,刘守仁,程瑞禾,代蓉,石国庆,艾君涛,杨利国. 2005

[12]微卫星标记OarAE101和BM1329承五个绵羊品种中的初步研究. 储明星,程金华. 2001

[13]绵羊BMPR-IB基因多态性与其产羔数的相关研究. 王启贵,钟发刚,李辉,王新华,刘守仁,陈晓军. 2003

[14]绵羊TrkA基因的表达及其SNPs与产羔性状的关联性分析. 张军霞,乐祥鹏,王维民,王志兰,张娜娜,胡瑞雪,谢云龙,孙武,邓颖. 2016

[15]绵羊催乳素受体基因外显子10多态性及其与产羔数相关分析. 张向楠,孙伟,储明星,张有法,陈玲. 2012

[16]绵羊KITLG基因的表达及其多态性与产羔性状关联分析. 张军霞,乐祥鹏,王维民,谢云龙,王志兰,张娜娜,胡瑞雪,孙武,邓颖,李发弟,喇永富. 2017

[17]绵羊SMAD1基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析. 田志龙,汤继顺,孙庆,王玉琴,张效生,张金龙,储明星. 2019

[18]绵羊产羔数相关基因的研究进展. 胡瑞雪,乐祥鹏,李万宏,李发弟,王维民. 2017

[19]绵羊多羔主效基因FecB高通量检测方法的建立及应用. 刘秋月,胡文萍,贺小云,潘章源,郭晓飞,冯涛,曹贵玲,黄冬维,贺建宁,狄冉,曹晓涵,王翔宇,储明星. 2017

[20]SIX1基因表达及其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数的关联分析. 李春艳,狄冉,张彦,任春环,张子军,刘秋月,胡文萍,王翔宇,张效生,张金龙,储明星. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序