桃花花型(铃形/蔷薇形)基因型鉴定、分子标记开发与利用
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吉爽秋
作者: 吉爽秋;王力荣;李勇;朱更瑞;曹珂;方伟超;陈昌文;王新卫;张琦;吴金龙
作者机构:
关键词: 桃;花型;全基因组关联分析(GWAS);IGV;竞争性等位基因特异性PCR(KASP)
期刊名称: 果树学报
ISSN: 1009-9980
年卷期: 2023 年 003 期
页码: 422-431
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】进一步完善桃花型基因型分类,开发桃花型相关分子标记,为观赏桃花的分子辅助育种提供理论支持。【方法】利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)、IGV可视化软件分析,以及竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术,在定位到的候选位点进行鉴定分析。【结果】GWAS定位分析在Pp08:14 518 604~14 521 291 bp存在一个ms179810转座子的缺失,x2验证结果表明,转座子的插入与缺失与花型性状无显著性关系。在转座子上游33 980 bp处鉴定到一个单碱基核苷酸(SNP)变异,变异类型分为CC型、AC型、AA型3种,比对结果显示基因型为CC型、AC型,其表型为铃形,基因型为AA型,其表型为蔷薇形,在145份桃自然群体中鉴定准确率为98.62%。但是通过表型比对发现,基因型为CC时,铃形花冠直径为(1.54±0.46)cm,同时,基因型杂合的中蟠17号自交群体后代192株中基因型与表型准确率在98.44%。【结论】根据桃基因组中Pp08:14 484 624 bp处的变异类型以及桃花型的调查结果,首次将铃形花基因型细分为纯合铃形和杂合铃形,且开发了同时鉴定纯合铃形、杂合铃形及蔷薇形的分子标记。
分类号: S662.1
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