陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈义珍
作者: 陈义珍;李浩;傅明川;王立国;刘任重;柳展基
作者机构:
关键词: 陆地棉;膜结合脂肪酸去饱和酶;全基因组鉴定;生物信息学分析;基因表达;干旱和盐胁迫;褪黑素
期刊名称: 山东农业科学
ISSN: 1001-4942
年卷期: 2023 年 004 期
页码: 11-23
收录情况: 北大核心
摘要: 膜结合脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase, FAD)是生物合成不饱和脂肪酸的关键酶。本研究以陆地棉基因组数据为基础,利用生物信息学方法对棉花FAD基因家族进行全基因组鉴定和进化分析。结果表明,陆地棉基因组中共含有37个FAD基因,进化分析发现这些基因分为4个亚家族,各亚家族成员数量不一,但相同亚家族成员含有相似的基因结构和保守基序。共线性分析发现28对复制基因全为片段复制基因,且都经历了严格的纯化选择作用。此外,在陆地棉FAD基因的启动子区域,发现了丰富的响应植物激素信号和逆境胁迫的顺式作用元件。转录组分析表明,陆地棉FAD基因家族响应干旱和盐胁迫,定量PCR分析表明施加外源褪黑素显著影响了FAD基因的表达。本研究结果为进一步解析FAD家族基因的功能奠定了基础。
分类号: S562
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