灰葡萄孢鞘脂代谢通路基因Bcsphl1克隆及功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李俊

作者： 李俊;宋娟娟;周映君;李国庆;张静

作者机构：

关键词： 灰葡萄孢;鞘氨醇羟化酶;基因克隆;基因表达;菌核形成;功能

期刊名称： 植物保护学报

ISSN： 0577-7518

年卷期： 2022 年 49 卷 004 期

页码： 1046-1052

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为明确灰葡萄孢Botrytis cinerea鞘脂代谢通路基因Bcsphl1的生物信息学特征及其在菌核发育中的潜在功能,采用CTAB法和Trizol法提取灰葡萄孢菌丝、菌核的gDNA和总RNA,利用PCR技术克隆其BcSphl1基因,运用生物信息学软件对其进行鉴定和分析,并利用半定量反转录-聚合酶链反应(semi-quantitative reverse transcription and polymerase chain reaction,SqRT-PCR)技术测定其在灰葡萄孢菌核不同形成阶段的表达情况.结果表明:Bcsphl1基因序列全长1 833 bp,编码360个氨基酸;Bcsphl1基因编码蛋白的分子质量为40.94 kD,理论等电点为7.73,分子式为C1889H2868N4920507S11,不稳定系数为31.19,脂肪指数为100.47,亲水性平均指数为0.160,属于结构稳定的疏水性蛋白.该基因编码的蛋白质无信号肽,定位于细胞质膜,含有3个跨膜结构域和1个脂肪酸羟化酶保守结构域.氨基酸序列同源性比对发现Bcsphl1氨基酸序列与灰葡萄孢T4菌株鞘氨醇羟化酶类蛋白的一致性达98.23%.Bcsphl1基因在灰葡萄孢菌核形成初期(6 d)、中期(9 d)和后期(12 d)均有较高水平表达,其中在中期表达水平最高,表明其可能参与灰葡萄孢菌核形成的调控.

分类号： S432.44

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