花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杜普旋
作者: 杜普旋;刘浩;胡冬秀;陈小平;洪彦彬;李友国
作者机构:
关键词: 花生;紫色酸性磷酸酶;生物信息学;基因家族
期刊名称: 中国油料作物学报
ISSN: 1007-9084
年卷期: 2022 年 44 卷 003 期
页码: 522-531
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatase,PAP)是一类金属磷酸酯酶,参与植物的磷素利用、碳代谢、细胞壁合成等多种生理功能,尤其是对磷缺乏的适应.本研究利用生物信息学手段在花生(Arachis hypogaea L.)全基因组水平上对PAP基因家族进行了鉴定,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构以及它们在22个组织中的表达模式进行了分析.结果表明:花生基因组中有39个AhPAP基因,氨基酸序列长度为205~905,等电点大多数都小于7,蛋白质C端均含有金属磷酸酶结构域.以花生、拟南芥、水稻、苜蓿共74个PAP蛋白构建的系统发育树可分为四组,每组中都含有来自不同物种的PAP,并没有因为物种差异而各自聚为一类.AhPAP基因家族中部分成员的表达具有组织特异性,arahy.P03NME、arahy.DAPS6C在根瘤中表达量最高,而它们在其他组织中表达量较低或未检测到表达.本研究为揭示AhPAP基因家族在花生中的生物学功能奠定了基础.
分类号: S565.2%Q785
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