小麦Whirly基因家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙月

作者： 孙月;杨慧玉;朱文根;王小燕;唐益苗

作者机构：

关键词： 小麦;Whirly基因家族;生物信息学分析;非生物胁迫;表达分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2023 年 31 卷 002 期

页码： 223-231

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Whirly家族属于植物特有的转录因子,在多种植物生长发育、抗病和胁迫响应等方面发挥着重要作用.为探究小麦(Triticum aestivum)Whirly家族成员数量及潜在功能,本研究借助生物信息学方法,对鉴定到的6个TaWHYs成员(分别命名为TaWHY1-A,TaWHY1-A-1,TaWHY1-D,TaWHY2-A,TaWHY2-B,TaWHY2-D)进行蛋白理化性质、基因结构、蛋白三维结构及系统进化分析;使用qPCR对TaWHYs成员在干旱、高温、低温胁迫下的表达模式进行分析.结果表明,TaWHYs蛋白不稳定指数为30~60,亲水性平均系数小于0,蛋白性质稳定,属于亲水蛋白.亚细胞定位预测显示,TaWHYs蛋白在细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体中均有分布.TaWHYs蛋白二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,存在2种三维结构模型.转录组数据分析表明,TaWHY基因表现出不同的组织表达模式,并受到低温、高温、干旱等不同非生物胁迫的调控.qPCR结果表明,TaWHY1-A基因在低温胁迫条件下相对表达量显著上调(P<0.05),能够响应低温胁迫.本研究结果为更深层次的TaWHY功能验证和作用机理分析提供参考.

分类号： S330

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