基于SLAF-seq技术构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵绪涛
作者: 赵绪涛;柳海东;李开祥;贾永鹏;杜德志
作者机构:
关键词: 甘蓝型油菜;波里马雄性不育恢复系;SNP分子标记;SLAF标签;核心种质
期刊名称: 中国油料作物学报
ISSN: 1007-9084
年卷期: 2019 年 04 期
页码: 497-506
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为加快选育适应春油菜区的强优势杂交种,构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质,以118份波里马不育系的恢复系为材料,利用简化基因组测序技术(SLAF-seq),开发SNP标记,分析群体遗传关系,结合Core Hunter软件进行核心种质构建,得到2516个有效SNP标记位点。基于有效SNP标记,对118份资源进行遗传分析,结果显示:恢复系间平均Nei's遗传距离为0.319,含有不同遗传成分的恢复系之间遗传距离较大;118份资源被聚成5类,来源相同的材料大多被分为同一类;获得两个符合要求的核心种质子集,分别包含34份材料和46份材料,分别命名为C30和C40。通过评价这两种核心种质,等位基因覆盖度都达到了99.8%以上,MR(罗杰斯距离)和CE(卡瓦利-爱德华距离)两种遗传距离指数相差不大,且多态性含量达到了0.28,表明构建的甘蓝型油菜恢复系的核心种质可以代表118份资源,符合植物资源核心种质的构建要求。
分类号: S565.4
- 相关文献
[1]基于SNP分子标记的广西玉米种质材料类群结构分析及核心种质构建. 陈坤,黄安霞,周锦国,卢生乔,覃宏宇,韦正乙,弓雪,刘亚利,张述宽,钟昌松. 2025
[2]基于全基因组关联分析挖掘甘蓝型油菜油酸含量QTL与SNP分子标记. 李敏,方正,陈俊锟,梁龙兵,向阳. 2024
[3]特早熟甘蓝型春油菜恢复系核心种质构建. 林晓阳,杜德志,柳海东,李钧. 2022
[4]甘蓝型油菜一个代表性核心种质的遴选. 任丽平,倪西源,黄吉祥,雷伟侠,曹明富. 2008
[5]甘蓝型油菜恢复系的群体结构解析及核心种质构建. 张格格,柳海东,杜德志. 2023
[6]基于SLAF-seq技术的石斛兰SNP标记开发及亲缘关系分析. 崔学强,黄昌艳,邓杰玲,李先民,李秀玲,张自斌. 2023
[7]高粱单核苷酸多态性(SNP)标记开发研究初报. 籍贵苏,吕芃,杜瑞恒,刘国庆,侯升林,马雪,李素英,王金萍,赵秀萍. 2018
[8]基于SLAF标签测序分析广东省栽培稻种质资源的遗传结构及演化关系. 孙炳蕊,潘大建,李晨,江立群,张静,吕树伟,刘清,毛兴学,陈文丰,范芝兰. 2022
[9]利用PCR产物混池重测序检测梨褐皮关联SLAF标签多态性. 蒋爽,王晓庆,施春晖,李水根,骆军. 2024
[10]基于PARMS技术的绿豆抗叶斑病基因VrTAF5分子标记的开发. 李灵慧,吴然然,陈景斌,崔晓艳,袁星星,朱月林,陈新. 2021
[11]利用SLAF-seq技术开发黄瓜白粉病抗性分子标记. 张鹏,朱育强,王丽莉,周胜军. 2017
[12]基于家蚕抗血液型脓病新品种的SNP分子标记开发. 钱荷英,李刚,李龙,赵国栋,徐安英. 2018
[13]中国南瓜果皮颜色基因连锁的SNP分子标记的开发及应用. 周洋洋,黄河勋,李俊星,罗少波,吴廷全,钟玉娟. 2018
[14]SNP分子标记对bmr6和bmr12型褐色中脉高粱种质鉴定. 张国琴,葛玉彬,张正英. 2023
[15]吉林省大豆品种(系)遗传多样性分析. 吕叶,董青松,陈亮,侯云龙,刘德泉,王跃强,张君,王新风,张玲,于维,邱红梅. 2024
[16]SNP标记分型与品质分析联合的麦芽纯度及品种真实性鉴定. 徐东东,张利莎,董国清,谷方红,王德良,袁兴淼,张京,郭刚刚. 2015
[17]基于SNP分子标记构建黄瓜指纹图谱. 王欣,张鹏,朱育强,孙玉燕,董文其,周胜军. 2024
[18]梨形环棱螺6个地理种群遗传多样性与遗传分化分析. 李珂,马学艳,杨轲,陈琬雯,金武,闻海波. 2024
[19]基于SNP标记的玉米散粉吐丝间隔期QTL定位. 陈坤,刘亚利,覃宏宇,周锦国,弓雪,韦正乙,钟昌松,杨耀迥,卢生乔,张述宽. 2024
[20]基于SNP分子标记的95个热带亚热带玉米自交系遗传多样性分析. 王兵伟,何静丹,郑加兴,韦绍丽,周步进,覃嘉明,黄安霞,时成俏. 2025
作者其他论文 更多>>
-
特早熟甘蓝型油菜新品种青杂有限1号高产栽培技术研究
作者:徐亮;唐国永;王宗昌;杜德志
关键词:甘蓝型油菜;青杂有限1号;栽培技术
-
292份甘蓝型油菜品系自交不亲和位点基因型鉴定
作者:李金洺;李开祥;杜德志
关键词:甘蓝型油菜;自交不亲和;分子标记
-
青海省油菜种业发展现状与对策建议
作者:金萍;柳海东
关键词:青海省;油菜种业;发展现状;对策建议
-
基于InDel标记的春油菜品种指纹图谱构建和杂交种纯度鉴定
作者:何鸟飞;赵绪涛;李开祥
关键词:甘蓝型油菜;分子标记;香农指数;等位基因数;聚类分析;恢复系;细胞质雄性不育系
-
甘蓝型油菜籽粒密度QTL位点cqSD-A9的SSR标记开发及应用
作者:王浩君;谢立人;李开祥
关键词:甘蓝型油菜;籽粒密度;cqSD-A9位点;SSR分子标记
-
甘蓝型油菜开花时间的数量遗传分析
作者:赵洪平;张永顺;赵志;肖麓;杜德志
关键词:甘蓝型油菜;开花时间;主基因+多基因
-
青海省春油菜主推品种的指纹图谱构建和纯度鉴定
作者:王国邦;谢立人;杜德志;李开祥
关键词:甘蓝型油菜;SSR标记;指纹图谱;纯度鉴定
