玉米穗轴粗全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马娟

作者： 马娟;曹言勇;李会勇

作者机构：

关键词： 玉米;全基因组关联分析;FarmCPU;穗轴粗

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 007 期

页码： 1228-1238

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 玉米穗轴粗是一个影响玉米产量和穗轴产量的重要性状,其遗传机制的解析可以对高产育种提供指导。本研究以309份玉米自交系为材料,利用测序基因型分型技术对其进行基因型鉴定。采用FarmCPU（fixed and random model circulating probability unification）、MLMM （multiple loci mixed linear model）和CMLM （compressed mixed linear model）方法,对2017年和2019年河南原阳、河南郸城、河南虞城、海南三亚以及最佳线性无偏估计值环境的穗轴粗,进行全基因组关联分析,共鉴定12个与穗轴粗显著关联的SNP （single nucleotide polymorphisms）（P<8.60E-07）。其中,S429277313利用FarmCPU和MLMM方法在2017年原阳均检测到。S129006330、S2170889116、S22046026464和S483821463的表型变异解释率介于10.23%～14.17%,为主效SNP。而且,S129006330位于已定位的穗轴粗QTL（quantitative trait loci）区间内。共挖掘17个候选基因,其中WAKL14（wall-associated receptor kinase-like 14）、转录因子ZIM35（zinc-finger protein expressed in inflorescence meristem 35）、HMGA（HMG-Y-related protein A）、组蛋白-赖氨酸N甲基转移酶ATX4（Arabidopsis trithorax 4）和XTH32（xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 32）,可能是影响穗轴粗的重要基因。挖掘的4个穗轴粗主效SNP和5个候选基因可以为分子标记辅助育种、精细定位和基因克隆提供信息。

分类号： S513

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