干旱胁迫下青稞全基因组可变剪切分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 曾兴权
作者: 曾兴权;原红军;杨春葆;于明寨;徐齐君;王玉林;扎桑;尼玛扎西
作者机构:
关键词: 青稞;干旱胁迫;全基因组;可变剪切分析
期刊名称: 西藏农业科技
ISSN: 1005-2925
年卷期: 2019 年 01 期
页码: 1-5
摘要: 为阐明青稞在旱胁迫下基因发生可变剪切的规律,本研究以抗旱的"喜拉16号"和旱敏感的"迪庆黑元桂"为试验材料,分别对对照和21%PEG浓度下处理的样本进行多时间点的全转录组测序。结果表明,利用Leaf Cutter软件在所有的样品中共检测到了22 181个可变剪切事件;通过PCA分析发现,可变剪切具有明显的品种间特异性;另外,通过与抗旱基因数据库比对分析发现,在干旱胁迫处理下2个类型品种间有多个抗旱相关的基因发生了显著的差异可变剪切,分别是HVUL1H16429 (AtrbohF)、HVUL1H12808 (HAB1)、HVUL4H58649 (ABF4)、HVUL4H35985 (AtrbohD)、HVUL7H07799 (LOS5)、HVUL3H43774 (CLCc)、HVUL3H23631(ABCG40)、HVUL1H16840(MYB60)和HVUL6H08236(AREB1);对2个品种各自在对照与旱胁迫条件下的差异可变剪切基因进行pathway分析,发现了抗旱品种的差异可变剪切基因参与了更多的pathway,并且鉴别出Fatty acid degradation、Inositol phosphate metabolism、alpha-Linolenic acid metabolism和Fatty acid metabolism这4条通路显著富集。为解析青稞抗旱分子机理与培育青稞抗旱新品种奠定了理论基础。
分类号: S512.3
- 相关文献
[1]马铃薯StIgt基因家族的鉴定及其对干旱胁迫的响应分析. 秦天元,刘玉汇,孙超,毕真真,李安一,许德蓉,王一好,张俊莲,白江平. 2021
[2]青稞HbSnRK2.4的克隆及其序列特征与表达特性分析. 曾兴权,王玉林,徐齐君,原红军,韦泽秀,尼玛扎西. 2015
[3]青稞HbTsi1的克隆及其序列特征与表达特性分析. 曾兴权,王玉林,原红军,徐齐君,尼玛扎西. 2015
[4]西藏青稞品种喜玛拉雅10号干旱胁迫的SSH文库构建及干旱诱导表达基因分析. 曾兴权,尼玛扎西,于静娟,唐亚伟,韦泽秀,其美旺姆,达瓦顿珠,刘仁建,雄奴塔巴,扎西罗布,高丽云. 2012
[5]干旱胁迫时青稞叶片游离脯氨酸含量变化研究. 刘仁建. 2014
[6]不同基因型青稞苗期耐旱综合评价. 李洁,姚有华,邓智婷. 2020
[7]西藏青稞抗旱相关基因表达模式分析研究. 原红军. 2015
[8]干旱、盐胁迫及盐旱复合胁迫对青稞幼苗生理生化特性的影响. 郑庆柱,谭海运,高雪,纪雪峰,田侠. 2020
[9]PEG模拟干旱胁迫处理对青稞幼苗生长和生理特性的影响. 王玉林,徐齐君,原红军,曾兴权,尼玛扎西. 2018
[10]青稞法尼基转移酶β亚基编码基因HbERA1的克隆及表达分析. 原红军,曾兴权,王玉林,徐齐君,韦泽秀,尼玛扎西. 2014
[11]不同耐旱性青稞叶片差异蛋白分析. 李洁,付惠,姚晓华,吴昆仑. 2021
[12]花生膜联蛋白基因家族成员的结构和表达分析. 王慧敏,李新国,万书波,张智猛,丁红,李国卫,高文伟,彭振英. 2019
[13]森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,张豫超,杨肖芳,蒋桂华. 2012
[14]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013
[15]甜瓜全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,蒋明,李建波,寿森炎. 2014
[16]企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析. 施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良. 2009
[17]PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析. 曹宗喜,郑心力,张艳,叶保国,林哲敏,王峰. 2015
[18]猫杯状病毒全基因组的克隆及序列分析. 郑翠玲,向华,宣华,王延树,严悌昆. 2010
[19]猪源乙型脑炎病毒河南分离株的全基因组测序及进化分析. 禹乐乐,滕蔓,罗俊,迟佳琦,余祖华,柴书军,梁晓晓,张改平,王爱萍. 2012
[20]鸭病毒性肝炎病毒NA株全基因序列测定及分析. 王劭,陈少莺,朱小丽,程晓霞,陈仕龙,林锋强,李兆龙. 2010
作者其他论文 更多>>
-
青稞酵母双杂文库的构建及HVUL0H33228.2互作蛋白的筛选
作者:羊海珍;顿珠加布;徐齐君
关键词:青稞;白粉病;cDNA文库;HVUL0H33228.2;互作蛋白
-
西藏拉孜县青稞新品种适应性分析及栽培技术
作者:巴桑普赤;赵彩霞;杨广环;曾兴权;高小丽
关键词:拉孜县;青稞;农艺性状;适应性;栽培技术
-
金龟子绿僵菌固态发酵条件的响应面优化研究
作者:尼玛扎西;王壮壮;黄玉;张国强;刘国一
关键词:金龟子绿僵菌;固态发酵;产孢量;响应面;优化
-
大麦HvNRT2.3/HvNRT2.5基因对拟南芥生长发育及产量性状的影响
作者:郭宝健;李赢;王玉林;吕超;王菲菲;许如根
关键词:大麦;硝酸盐转运蛋白;拟南芥;超表达
-
国内外青稞材料白粉病田间抗性鉴定
作者:旺姆;杨春葆;原红军
关键词:青稞;白粉病;抗性鉴定;西藏
-
西藏青稞抽穗期多样性与稳定性分析
作者:卓嘎;达瓦顿珠;扎桑;普布卓玛;旺姆;伦珠朗杰
关键词:青稞;抽穗期;多样性;稳定性
-
施氮量与种植密度对'中烟100'烟叶产量及化学成分的影响
作者:王玉林;孙延国;高峻;管恩森;段旺军;石屹;吴元华;王晓琳
关键词:施氮量;种植密度;烟草;生长发育;产质量;化学成分