杀鲑气单胞菌SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘帅
作者: 刘帅;卢彤岩;王荻;曹永生;贾钟贺;王渊博;李绍戊
作者机构:
关键词: 杀鲑气单胞菌;fstA基因;SYBR-GreenⅠ;实时荧光定量PCR
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2017 年 07 期
页码: 2884-2891
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据GenBank中杀鲑气单胞菌铁载受体(ferric siderophore receptor,fst A)基因序列设计并合成一对特异性引物,经过反应体系优化后建立了检测杀鲑气单胞菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。将fst A基因克隆到p MD18T载体上构建重组质粒pMD18T-fst A并制备标准曲线,结果显示该标准曲线的线性关系良好,扩增所得标准曲线为y=-4.255 2x+39.644,相关系数R2为0.988;熔解曲线分析显示产物为单一的特异峰。特异性检测结果表明,该方法对杀鲑气单胞菌及其亚种具有良好的特异性,与其他细菌不发生交叉反应;最低检测限为35拷贝/μL,较常规PCR的灵敏度高出约100倍。应用建立的方法对人工感染的虹鳟病样进行了检测,待检样品均呈阳性反应,表明该方法具有很好的适用性。研究表明,所建立的实时荧光定量PCR方法具有特异、灵敏、快速、定量的优点,可用于杀鲑气单胞菌的快速诊断及定量检测。
分类号: S941.4
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