狂犬病毒GSQY-Dog-China-2013株全基因组序列测定和遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 邢广旭
作者: 邢广旭;姜中毅;焦文强;王方雨;张改平
作者机构:
关键词: 狂犬病病毒;GSQY-Dog-China-2013;全基因组序列测定;遗传进化分析
期刊名称: 中国兽医杂志
ISSN: 0529-6005
年卷期: 2023 年 001 期
页码: 8-13
收录情况: 北大核心
摘要: 为了全面分析我国狂犬病病毒遗传进化情况,本试验使用反转录PCR(RT-PCR)方法将狂犬病病毒GSQY-Dog-China-2013分为10个片段进行扩增,回收目的片段并与pMD20-T simple载体连接,转化JM109感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序;使用DNASTAR软件中的Edit Seq通过拼接相邻片段之间的重叠序列获得GSQY-Dog-China-2013全基因组序列,构建系统进化树进行遗传进化分析。结果显示,GSQY-Dog-China-2013全长11 924核苷酸(nt),包含5个开放阅读框,分别编码核蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)、糖蛋白(G)和转录大蛋白(L);基于全基因组序列的进化树分析显示,GSQY-Dog-China-2013株和国内分离株形成一个分支,在国内分离株中与SXYL15株和SXBJ15株形成一个分支,亲缘关系最接近,提示GSQY-Dog-China-2013可能源自我国陕西省。本试验系甘肃省首次报道狂犬病病毒全基因组序列,进一步丰富了我国狂犬病病毒遗传进化数据,为狂犬病全面防治以及疫苗研发提供了数据支持。
分类号: S852.65
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