玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谭贤杰

作者： 宋燕春;石云素;程伟东;吴子恺;王天宇;黎裕

作者机构：

关键词： Rubisco活化酶(RCA);单核苷酸多态性(SNP);InDel;连锁不平衡(LD);单倍型;单倍型标签SNP

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2011 年 37 卷 01 期

页码： 58-66

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。

分类号： S513

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