刺参消化道内含物细菌群落组成的PCR-DGGE分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高菲

作者： 高菲;孙慧玲;许强;谭杰;燕敬平;王清印

作者机构：

关键词： 刺参;PCR-DGGE;消化道内含物;细菌群落

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2010 年 17 卷 04 期

页码： 671-680

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用PCR-DGGE技术研究刺参(Apostichopus japonicus)前肠、中肠和后肠内含物的细菌群落组成。通过软件Bio-rad Quantity one分析DGGE指纹图谱,发现刺参后肠内含物的条带数目显著高于前肠和中肠(P=0.003,P=0.016),表明刺参后肠内含物的细菌多样性最高,其次是中肠;前肠内含物的细菌多样性最低。UPGMA聚类分析发现,不同刺参个体其后肠的细菌群落组成差异最小,前肠的细菌群落差异最大。经DGGE分离、条带切割和序列测定,共获得了13条序列,系统发育分析表明,刺参消化道内含物的细菌群落可主要归属于5大类群,即α-变形菌纲(α-proteobacteria)、γ-变形菌纲(γ-proteobacteria)、δ-变形菌纲(δ-proteobacteria)、拟杆菌纲(Bacteroidetes)和柔膜菌纲(Mollicutes)。刺参前肠、中肠和后肠内含物的优势菌群均为γ-proteobacteria。Blast分析显示,其中12条与之亲缘关系最近的序列来自从海洋环境中获得的细菌克隆,表明刺参消化道的细菌群落可能直接或间接来源于刺参的栖息地环境。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]刺参养殖池环境细菌群落对底质改良剂的响应. 李晓龙,李秋芬,姜娓娓,刘淮德,王晓红,宋娴丽,安鑫龙. 2015

[2]不同碳源促进污染水体氮素转化的微生态过程. 赵佩文,王新,吴逸飞,姚晓红,柳永,孙宏,葛向阳,汤江武. 2016

[3]象山港中部养殖区细菌群落结构的特征及其在生境修复过程中的变化. 李秋芬,有小娟,张艳,毛玉泽,焦海峰. 2013

[4]不同养殖方式对鳙肠道细菌群落结构的影响. 夏耘,余德光,谢骏,王广军,郁二蒙,谢瑞涛. 2017

[5]抗生素对于对虾苗池水体细菌区系的影响. 张吕平,胡超群,罗鹏,谢珍玉,李卓佳. 2009

[6]豆粕固态发酵条件优化及发酵过程中细菌群落结构分析. 吴逸飞,姚晓红,王新,孙宏,钱彬. 2011

[7]草鱼养殖池塘蓝藻暴发时水体细菌群落特征分析. 李建松,王广军,龚望宝,谢骏,余德光,郁二蒙,魏南,夏耘. 2016

[8]浒苔腐烂过程中水体细菌群落结构变化的PCR-DGGE分析. 张艳,李秋芬,孙雪梅,陈聚法,赵俊. 2012

[9]豆粕固态发酸条件优化及发酵过程中细菌群落结构分析. 吴逸飞,姚晓红,王新,孙宏,钱彬,张博,汤江武. 2011

[10]果洛地区冻土细菌群落的多样性分析. 韩睿,朱德锐,陈来生,封希媛,刘静,孙琦龙. 2016

[11]新疆断裂带泉水中细菌群落结构的PCR-DGGE分析. 吴江超,高小其,曾军,徐建华,杨晓芳,娄恺. 2011

[12]脆化草鱼与氹仔草鱼的肠道细菌群落PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析. 郁二蒙,余德光,毕香梅,谢骏,王广军,龚望宝,王海英,李志斐. 2012

[13]栉孔扇贝消化盲囊细菌群落组成的季节变化分析. 杨彩霞,李赟,张婧宇,王崇明. 2012

[14]湖鲚体内与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析. 聂志娟,徐钢春,程起群,杜富宽,张勇,顾若波,朱文龙. 2015

[15]PCR-DGGE技术在土壤微生物多态性研究中的应用. 罗青. 2006

[16]两纯系鸡胃肠道黏膜细菌16S rDNA的PCR-DGGE分析比较. 张洁,容庭,刘志昌,王刚,林海丹,贝锦龙,陈庄. 2013

[17]两纯系鸡胃肠道黏膜细菌l6S rDNA的PCR-DGGE分析比较. 张洁,容庭,刘志昌,王刚,林海丹. 2013

[18]PCR-DGGE方法解析大豆根际不同距离的土壤细菌群落多样性特征. 于洪涛,申忠宝,沈德茹,金剑,王光华. 2010

[19]土壤镰刀菌种群检测的巢式PCR-DGGE方法的建立. 程晓亮,纪莉景,王连生,栗秋生,朱杰华,孔令晓. 2010

[20]低磷胁迫对番茄根系生长及根际土壤细菌多样性的影响. 姚华开,刘岳飞,杨尚东. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序