陆地棉NF-YB基因家族的全基因组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘静
作者: 刘静;徐珍珍;袁娜;郭月;张保龙;杜建厂
作者机构:
关键词: NF-YB基因家族;陆地棉;生物信息
期刊名称: 华北农学报
ISSN: 1000-7091
年卷期: 2016 年 31 卷 05 期
页码: 21-27
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了进一步了解NF-YB基因家族结构的功能,利用生物信息学手段,系统研究了陆地棉标准系TM-1基因组中NF-YB基因家族的数目、亚细胞定位、染色体分布、进化关系、基序以及组织表达情况。结果表明:TM-1基因组中共有41个NF-YB基因家族成员,它们含有相同的CBFD_NFYB_HMF结构域,大部分定位到细胞核内;41个NF-YB基因家族成员分布在19条染色体上,其中有19组成员在A亚组和D亚组中表现为直系同源基因;进化树分为Ⅰ和Ⅱ2个小组,每个小组成员间具有相似的基序类型和排列顺序;组织表达分析则发现,在这41个NF-YB基因家族成员中,至少有24个成员可以进行表达,且表现出一定的组织特异性。
分类号: S562
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