谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应

文献类型： 中文期刊

第一作者： 霍冬英

作者： 霍冬英;郑炜君;李盼松;徐兆师;周永斌;陈明;马有志;闵东红;张小红

作者机构：

关键词： 谷子;F-box蛋白;亚细胞定位;干旱响应;诱导机制

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2014 年 40 卷 09 期

页码： 1585-1594

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： F-box蛋白参与细胞周期调控、细胞凋亡及信号转导等多种生命活动,对维持植物正常生长发育a和介导非生物胁迫响应等过程发挥重要作用。谷子具有显著的耐旱耐瘠薄等特性,本研究根据谷子转录组分析结果,从525个F-box家族成员中鉴定出19个在干旱胁迫下表达量上调的F-box基因,根据序列相似性将其分为6类,同一类基因具有相似的内含子-外显子结构。染色体定位分析发现,这些基因分别分布在谷子的8条染色体上,其中,第2条染色体上含F-box基因最多,有6个。结构域分析结果表明,19个F-box蛋白均含保守的F-box结构域,而C端含FBD、WD40、FBA、ZnF、Kelch和LRR等结构域。启动子元件分析表明,谷子19个F-box基因均含逆境应答元件,其中,MYB和MYC元件的数量最多(9~78个),说明这些基因对干旱应答反应可能主要受MYB、MYC转录因子调控。转录组分析结果表明,SiF-box18基因对干旱胁迫的响应远远高于其他F-box成员,对干旱、高盐、ABA、SA和JA都有响应;亚细胞定位结果显示,SiF-box18蛋白定位在细胞核中。本研究为进一步深入了解SiF-box18基因的功能提供了依据。

分类号： S515

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