中国野生柑橘上衰退病毒分离株分子特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 易龙

作者： 易龙;周常勇;周彦;王志刚;唐科志

作者机构：

关键词： 野生柑橘;柑橘衰退病毒;多态性分析;序列比对;系统进化

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2007 年 40 卷 05 期

页码： 932-939

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】了解中国野生柑橘上携带柑橘衰退病毒(CTV)分离株的CP/HinfⅠRFLP组群构成和分子特征。【方法】运用RT-PCR对采自中国云南、广西、四川、湖南、江西等省11个野生柑橘上CTV分离株的病毒衣壳蛋白基因(CPG)进行扩增,利用RFLP和SSCP对CPG进行分析,并将测定的CPG序列进行同源性比较和聚类分析。【结果】发现野生柑橘上11个CTV分离株以单一组群感染为主;这些CTV分离株CPG的核苷酸序列和相应的氨基酸序列同源性分别为92.5%～99.5%和95.0%～100%;与GenBank收录的9个全基因组CTV分离株的相应基因序列进行聚类分析,其核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为92.1%～98.8%和94.6%～100%。【结论】序列同源性比较说明CTVCPG具有高度保守性,同时系统进化分析表明收集到的野生CTV分离株与国外分离株分属5大类群,具有较复杂的亲缘关系。

分类号： S436.66

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