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油莎豆基因组大小、倍性和系统发育分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王会伟 1 ; 朱世新 2 ; 张新友 1 ; 王艳 1 ; 杨铁钢 1 ; 张向歌 1 ; 王树峰 1 ; 李春鑫 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院经济作物科学研究所

2.郑州大学生命科学院

关键词: 油莎豆;基因组大小;基因组倍性;系统发育

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2023 年 001 期

页码: 34-41

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确黄淮地区油莎豆主栽品种和特色种质资源的基因组特性及与其近缘类群的系统发育关系,利用流式细胞仪和基因组Survey分析对6个油莎豆材料基因组大小、倍性进行评估,并基于核糖体DNA的外转录间隔区(External transcribed spacer,ETS)和内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS)序列分析其与近缘类群间的系统发育关系。流式细胞仪分析结果表明,6个油莎豆材料基因组在0.808 6~0.858 5 Gb,均值为0.826 4 Gb;基因组Survey分析结果表明,3种粒型油莎豆材料豫油莎2号、豫油莎3号、YYS-4的基因组大小、重复序列占比、GC含量、杂合率分别为0.697 9 Gb、81.02%、34.7%、0.28%,0.778 7 Gb、84.45%、36.4%、0.08%,0.790 6 Gb、83.75%、34.9%、0.19%;基因组Survey分析和花粉粒染色结果显示,3种粒型油莎豆材料均为三倍体。系统发育分析结果显示,6个油莎豆材料聚为油莎豆分支,该分支与香附子和头状穗莎草构成的分支形成亲缘关系较近的姐妹群,并与其余的C4植物(碎米莎草、长尖莎草等)构成C4植物分支。

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[1]3种粒型油莎豆种质特性分析. 李春鑫,王会伟,王艳,刘玉兰,陈道玉,杨铁钢. 2022

[2]油莎豆耐盐性评估及盐胁迫下幼苗根系转录组学分析. 王会伟,张向歌,李春鑫,许欣然,胡海燕,朱雅婧,王艳,张新友. 2023

[3]油莎豆茎豆萌发过程中内源激素含量的变化. 张向歌,宋万献,朱雅婧,于美琴,宋雯栩,王树峰,李居政,王会伟. 2023

[4]几种槭属植物亲缘关系的ITS序列分析. 张强,王慧娟,李艳敏,王利民,孟月娥,赵秀山. 2008

[5]信阳地区5种叶蝉的种类鉴定及亲缘关系分析. 乔利,秦道正,张丽,李伯辽,夏明聪,李慧龙,卢兆成. 2015

[6]高粱GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 宋迎辉,朱灿灿,代书桃,秦娜,王春义,张真,李君霞,平西栓. 2022

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