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黑斑原鮡皮肤组织结构及其COL1A1基因的克隆与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张颖 1 ; 尹家胜 1 ; 马波 1 ; 李宝海 1 ; 牟振波 1 ;

作者机构: 1.西藏自治区农牧科学院水产研究所;黑龙江水产研究所

关键词: 黑斑原鮡;皮肤;组织结构;COL1A1基因;生物信息学

期刊名称: 高原科学研究

ISSN: 2096-4617

年卷期: 2021 年 03 期

页码: 1-10

收录情况: CSCD

摘要: 采用组织学与分子生物学方法开展了黑斑原鮡皮肤组织结构和Ⅰ型胶原蛋白基因的表达特征研究。结果表明:(1)黑斑原鮡的皮肤裸露无鳞,均由表皮和真皮组成。黑斑原鮡表皮层由复层上皮细胞和黏液细胞以及基底细胞组成。其表皮层的厚度显著大于真皮层厚度,且不同部位表皮层的厚度各不同,但各部位真皮层的厚度接近。其中,腹部表皮层的厚度最厚,为(102.36±3.43)μm;头部最薄,为(66.91±9.73)μm。(2)黑斑原鮡头部、背部色素细胞含量丰富,腹部色素细胞含量较少。(3)黑斑原鮡Ⅰ型胶原蛋白的α1基因(COL1A1)的c DNA全长序列为6 683 bp,其开放阅读框为4 350 bp,编码1 449个氨基酸。(4)BLAST同源性分析结果显示,黑斑原鮡COL1A1基因的氨基酸序列与巨魾的同源性最高,为92.06%,呈现出较高的保守性。(5)系统进化树分析表明,该基因与巨魾处于同一支,亲缘性最近。(6)生物信息学分析显示,黑斑原鮡COL1A1蛋白质的相对分子质量为137.14 KDa,理论等电点是5.42,为α螺旋β折叠三重螺旋结构蛋白,含有1个COLFI结构域、1个VWC结构域、1个RPT1结构域、2个RPT3结构域和8个Pfam Collagen结构域。

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