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基于简化基因组的甜叶菊分子标记开发

文献类型： 中文期刊

作者： 孙雨茜 1 ; 倪万潮 2 ; 杜平 1 ; 崔晓霞 2 ; 郭书巧 2 ; 蒋璐 2 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院中心实验室

2.江苏省农业科学院经济作物所/江苏省生物学重点实验室

关键词： 甜叶菊;简化基因组测序(RAD-seq);简单重复序列(SSR);单核苷酸多态性(SNP);竞争性等位基因特异性PCR(KASP)

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2020 年 027 期

页码： 111-117

收录情况： CSCD

摘要： 本研究旨在筛选和开发具有多态性的甜叶菊基因组分子标记.选取4个甜叶菊品种为材料,利用简化基因组测序技术(RAD-seq)开发SSR和SNP标记.开发并验证了149对多态性丰富、重复性好、特异性高的简单重复序列(SSR)和4组功能性的SNP标记,开发的多态性基因组分子标记中包含了甜叶菊糖苷合成途径关键基因的新标记StKASPSNP-7.验证了基于KASP技术开发甜叶菊功能SNP标记的可行性,为甜叶菊遗传图谱构建、分子鉴定奠定了基础.本研究开发的SSR和SNP标记可应用于甜叶菊的遗传图谱分析、品种真实性的高效快速鉴定以及高糖苷含量新品种的开发.

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