您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

基于CO I和Cytb DNA条形码在鲌属鱼类物种鉴定中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王利华 1 ; 罗相忠 1 ; 王丹 1 ; 李伟 2 ; 李忠 1 ; 邹桂伟 1 ; 梁宏伟 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院长江水产研究所

2.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词: 鲌属;CO I;Cytb;物种鉴定;系统进化

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2019 年 49 卷 04 期

页码: 22-28

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究线粒体CO I和Cytb基因作为DNA条形码在鲌属鱼类鉴定中的可行性,分别扩增达氏鲌(Culter dabryi)、海南鲌(C. recurviceps)、尖头鲌(C. oxycephalus)、蒙古鲌(C. mongolicus)、拟尖头鲌(C. oxycephaloides)和翘嘴鲌(C. alburnus)六种鲌属鱼类线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(Cytochrome C oxidase subunit I,CO I)和细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)的基因片段,并对六种鲌属鱼类同源序列的碱基组成、种内与种间遗传距离以及系统进化分别进行分析。结果表明:长度为645 bp的COI基因片段中,A、T、G、C 4种碱基平均含量分别为25.65%、28.18%、18.33%和27.84%;长度为970 bp的Cytb序列片段中,A、T、G、C碱基平均含量分别为27.97%、27.93%、14.53%和29.57%。基于CO I基因序列的种间平均遗传距离为3.54%,种内平均遗传距离为0.17%,种间遗传距离为种内遗传距离的20.82倍;基于Cytb基因序列的种间平均遗传距离为5.92%,种内平均遗传距离为0.18%,种间遗传距离为种内遗传距离的32.89倍。基于COI基因的系统进化关系显示除尖头鲌与拟尖头鲌外,其余4种鲌均形成独立分支,而基于Cytb基因的系统发育关系显示六种鲌属均能独立形成分支,鲌属六种鱼能够进行有效区分,将CO I和Cytb作为DNA条形码进行鲌属鱼类的物种鉴定是可行的,联合使用可以获得更好的鉴定效果。

  • 相关文献

[1]山东近海习见鱼类DNA条形码及其电子芯片分析. 柳淑芳,李献儒,杜腾飞,庄志猛. 2016

[2]三峡库区鲌属鱼类线粒体COⅠ基因遗传多样性的初步分析. 王丹,程庆武,杨镇宇,连玉喜,叶少文,刘家寿,李钟杰,罗相忠,邹桂伟. 2015

[3]Low mtDNA Cytb diversity and shallow population structure of Eleutheronema tetradactylum in the East China Sea and the South China Sea. Wang, Jianjian,Sun, Peng,Yin, Fei.

[4]Pronounced population genetic differentiation in the rock bream Oplegnathus fasciatus inferred from mitochondrial DNA sequences. Xiao, Yongshuang,Li, Jun,Ma, Daoyuan,Wang, Yanfeng,Xiao, ZhiZhong,Xu, Shihong,Ren, Guijing.

[5]基于16S rRNA和Cyt b基因序列探讨2种梅童鱼的遗传分化. 马国强,高天翔,孙典荣. 2010

[6]罗非鱼选育群体Cytb与D-loop序列变异信息对比分析. 颉晓勇,李思发. 2014

[7]基于Cytb与D-loop的罗非鱼选育群体遗传结构对比分析. 颉晓勇,钟金香,李思发. 2014

[8]九种鲱科鱼类线粒体DNA细胞色素b基因相对速率测试及分歧时间估计(英文). 程起群,卢大儒. 2006

[9]怒江三种裂腹鱼属鱼类种群遗传结构. 岳兴建,汪登强,刘绍平,袁希平,张耀光,段辛斌,陈大庆. 2010

[10]栉孔扇贝、虾夷扇贝及其杂交子代线粒体COI和Cytb基因遗传多样性分析. 于涛,吴彪,杨爱国,周丽青,刘志鸿. 2016

[11]长江上游中华纹胸鮡遗传多样性及遗传结构研究. 张力文,田辉伍,陈大庆,刘绍平,段辛斌,汪登强. 2020

[12]基于线粒体Cytb序列的伯氏肩孔南极鱼群体遗传结构初步分析. 赵娜,马春艳,宋炜,冯春雷,王鲁民,张凤英,蒋科技,赵宪勇,马凌波. 2019

[13]鲫属鱼类DNA条码及种与亚种划分. 程磊,常玉梅,鲁翠云,曹顶臣,孙效文. 2012

[14]帘蛤科贝类rDNA内转录间隔区序列的研究(英文). 程汉良,夏德全,吴婷婷,孟学平,吉红九,董志国. 2006

[15]利用ND1、ITS1序列研究三种背角无齿蚌(Anodonta woodiana)分类学问题. 赵颖,陈修报,杨健,刘洪波. 2011

[16]基于COⅠ基因的西南大西洋部分经济鱼类DNA条形码鉴定. 张馨月,刘岩,张秀梅,高天翔. 2014

[17]中国东南沿海弹涂鱼科常见鱼类的遗传多样性和DNA条形码. 杨帆,何利军,雷光春,张爱兵. 2012

[18]帘蛤科4种养殖蛤群体遗传多样性和种间关系的fAFLP分析. 彭永兴,程汉良,夏德全,吴婷婷,孟学平,吉红九,董志国. 2008

[19]基于线粒体COⅠ基因鉴别云斑尖塘鳢和线纹尖塘鳢的分子标记. 陈海港,李伟,张新铖,朱新平. 2016

[20]DNA条形码技术在鲻科鱼类鉴定中的应用. 刘璐,孙典荣,李纯厚,韩志强,高天翔,宋娜. 2016

作者其他论文 更多>>