文献类型: 中文期刊
作者: 赵孟良 1 ; 郭怡婷 1 ; 任延靖 1 ;
作者机构: 1.青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室
关键词: 菊芋;WRKY;转录因子;鉴定分析
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2023 年 39 卷 002 期
页码: 116-125
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 菊芋属抗旱性物种,通过对菊芋转录组数据进行分析,筛选与菊芋响应干旱胁迫密切相关的WRKY转录因子基因,为明晰菊芋WRKY家族基因的功能奠定理论基础.采用生物信息学方法,对菊芋WRKY基因家族成员的理化性质、保守结构域、蛋白质三级结构及其与其他物种的系统进化关系进行分析,利用RT-qPCR方法检测干旱胁迫下,菊芋WRKY基因在种子、根、茎、 叶、花瓣及块茎的相对表达量,以及菊芋WRKY基因家族成员的转录水平.结果表明,在菊芋叶片中共鉴定出74个WRKY基因,序列长度为510-2040 bp,检测到的motif基序的长度为25-50个碱基,系统进化树分析显示,大部分HtWRKY基因能够与其他WRKY基因聚为一类;组织特异性表达分析结果显示,HtWRKY基因在花瓣和块茎的相对表达量较高,干旱诱导表达分析显示,分别有20个和19个HtWRKY基因在菊芋叶片和根中呈现出诱导后上升表达的趋势.HtWRKY参与了菊芋抵御干旱胁迫的过程.
- 相关文献
[1]不同海拔梯度菊芋碳水化合物代谢研究. 孙雪梅,李莉. 2012
[2]基于转录组测序数据的青稞WRKY基因家族的生物信息学分析. 蒋礼玲,陈丽华,尼玛扎西,马晓岗,黄胜雄,李高原. 2021
[3]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023
[4]种植密度对菊芋植物学性状及产量的影响. 侯全刚,李江,李莉,钟启文,马本元. 2005
[5]低位山旱地区菊芋栽培方式筛选试验. 李江,钟启文,马本元,李莉,侯全刚. 2006
[6]青芋1号菊芋种芋单重对产量的影响. 李莉,钟启文,马本元,侯全刚,李江. 2005
[7]菊芋及其高产栽培技术. 侯全刚,李莉,马本元,李江. 2004
[8]加工型菊芋新品种青芋3号的选育. 李屹,孙雪梅,钟启文,李莉. 2011
[9]三十份菊芋资源亲缘关系的SRAP分析. 马胜超,韩睿,任鹏鸿,杨世鹏,李莉. 2014
[10]菊芋种用块茎对比试验. 李江,李莉,钟启文,马本元,侯全刚. 2005
[11]菊芋不同部位DNA提取的比较研究. 赵孟良,韩睿,李莉. 2013
[12]干旱胁迫对菊芋苗期生长的影响. 李屹,黄高峰,孙雪梅. 2012
[13]菊芋SSR-PCR反应体系优化及3个品种的分子鉴别. 任鹏鸿,韩睿,马胜超,李莉. 2013
[14]菊芋基因组DNA提取方法的比较. 赵孟良,韩睿,马胜超,李莉. 2012
[15]菊芋叶绿体分离方法比较研究. 许盼盼,杨世鹏,王丽慧,孙雪梅,高洁铭,李莉,钟启文. 2019
[16]菊芋应答非生物逆境胁迫的生长发育及物质代谢研究进展. 赵孟良,任延靖,李莉,钟启文. 2019
[17]菊芋块茎果聚糖研究进展. 赵孟良. 2019
[18]不同海拔梯度菊芋碳水化合物代谢研究. 孙雪梅,李莉. 2011
[19]菊芋生长发育动态及光合性能指标变化研究. 钟启文,王怡,王丽慧,李莉. 2007
[20]贮藏期菊芋块茎碳水化合物含量变化动态研究. 孙雪梅,王丽慧,钟启文. 2011
作者其他论文 更多>>
-
球茎甘蓝MYB115转录因子的克隆与表达分析
作者:赵文菊;王紫莹;王鑫淼;巴桑措姆;李江;任延靖
关键词:球茎甘蓝;MYB115;序列分析;保守基序;亲缘关系;荧光定量PCR
-
基于转录组序列的芜菁SSR标记开发及应用
作者:李晓娟;赵文菊;赵孟良;邵登魁;马一栋;任延靖
关键词:芜菁;分子标记;转录组;遗传多样性
-
早熟结球甘蓝叶球农艺性状综合评价
作者:刘敏;邓昌蓉;邵登魁;常振;任延靖
关键词:结球甘蓝;农艺性状;模糊综合评价;变异分析;主成分分析;聚类分析
-
14份引进菠菜品种(系)在西宁地区温室的适应性
作者:田闵玉;任延靖;蔡晓锋;王紫莹;李莉;赵孟良
关键词:菠菜(Spinacia oleracea L.);品种比较;温室;适应性
-
药食饲同源蔬菜-芜菁
作者:任延靖
关键词:药食同源;芜菁;品种特征;栽培管理
-
47份大白菜品种的遗传多样性研究
作者:韩睿;赵孟良;孙世英;任延靖
关键词:大白菜;农艺性状;SSR;亲缘关系;遗传多样性
-
外源物质干预对逆境胁迫下植物生长代谢的影响研究进展
作者:任延靖;柳红
关键词:外源物质;逆境胁迫;植物;生长代谢;研究进展