文献类型: 中文期刊
作者: 孙佩智 1 ; 李宏 1 ; 赵小庆 2 ; 薄素玲 3 ; 张泽峰 1 ; 张强 4 ; 路战远 2 ;
作者机构: 1.内蒙古大学物理科学与技术学院
2.内蒙古自治区农牧业科学院
3.内蒙古医科大学计算机学院
4.内蒙古农业大学理学院
关键词: miRNA;3′UTR序列;匹配片段;作用区域偏好;G+C含量;配对率
期刊名称: 内蒙古大学学报(自然科学)
ISSN: 1000-1638
年卷期: 2021 年 002 期
页码: 150-161
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用。基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA 3′UTR序列为研究对象,分析了miRNA和其匹配片段在3′UTR序列上的位置偏好性。研究发现,miRNA与3′UTR序列相互作用的位置存在区域偏好。低G+C含量的miRNA主要作用在3′UTR序列的5′端和3′端,高G+C含量的miRNA主要作用在3′UTR序列的5′端。低G+C含量的匹配片段在3′UTR序列上没有明显的位置偏好,而高G+C含量的匹配片段集中分布在3′UTR序列的5′端。低配对率的匹配片段主要分布在3′UTR序列的两端,中等配对率的匹配片段主要分布在3′UTR序列的5′端。此外,还分析了miRNA与匹配片段的4种相互作用方式中配对率的差异。研究对于揭示miRNA对基因表达调控的多样性提供了新的思路。
- 相关文献
[1]mRNA序列与相应UTR中内含子序列的相互作用. 张强,赵小庆,薄素玲,曹艳娟,苏文霞. 2020
[2]miRNA在动物繁殖性能中的研究进展. 祁云霞,达赖,付绍印,何小龙,张兴夫,王标,特日格勒,刘永斌. 2018
[3]Dissecting the biological relationship between TCGA miRNA and mRNA sequencing data using MMiRNA-Viewer. Bai, Yongsheng,Ding, Lizhong,Rath, Ethan,Stuart, Gary,Bai, Yongsheng,Stuart, Gary,Baker, Steve,Jiang, Feng,Bai, Jenny M.,Wu, Jianghong,Jiang, Hui. 2016
作者其他论文 更多>>
-
胡麻亚麻酸亚油酸相关KASP标记的开发
作者:穆艳鑫;伊六喜;高凤云;赵小庆;周宇;贾霄云;何江峰;苏少锋;斯钦巴特尔
关键词:胡麻;脂肪酸;SNP标记;KASP基因分型;SNP验证
-
氮磷钾配施对油莎豆产量及肥料利用效率的影响
作者:曹秭琦;任永峰;路战远;张向前;赵小庆;董琦
关键词:油莎豆;肥料配施;产量;肥料利用效率;互作效应
-
马铃薯光合效率遗传分析及综合评价
作者:谢锐;金晓蕾;韩志刚;程玉臣;赵小庆;张向前;高艳蓉;郭景山;路战远
关键词:马铃薯;广义遗传力;主成分分析;聚类分析;高光效
-
滴灌水量对土壤水分变化特征和玉米水分利用效率的影响
作者:陈宣伊;师晶晶;张向前;杜香玉;步恒通;白东星;路战远;孟天天;王满秀;陈丽荣
关键词:滴灌;玉米;耗水量;产量;水分利用效率
-
膜侧种植技术及配套播种机具应用研究
作者:张勇;菅志亮;路战远;李素萍;张向前;赵小庆;张晓蒙;王治宇;路大波
关键词:膜侧种植;播种机具;应用效果;地膜回收
-
基于SSR标记的胡麻粗脂肪及脂肪酸组分的关联分析
作者:高凤云;斯钦巴特尔;周宇;贾霄云;苏少锋;赵小庆;金晓蕾
关键词:胡麻;品质;粗脂肪;脂肪酸组分;关联分析;SSR
-
耕作方式和灌水量对小麦生长发育及产量的影响
作者:郑美;且天真;路战远;那顺勿日图;李娟;张向前;程玉臣;张德健
关键词:小麦;耕作方式;灌水量;生长指标;产量