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适于大白菜杂交种纯度鉴定的核心引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 张晓宁 1 ; 卢旭 2 ; 王鑫 2 ; 吴海东 2 ; 王丽丽 2 ; 王玉刚 2 ; 冯辉 2 ;

作者机构: 1.沈阳农业大学园艺学院辽宁省十字花科蔬菜遗传育种重点实验室

2.沈阳农业大学园艺学院辽宁省十字花科蔬菜遗传育种重点实验室;辽宁省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 大白菜;杂交种;纯度鉴定;核心引物

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2016 年 01 期

页码: 168-176

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为筛选出一组核心引物用于大白菜杂交种的纯度鉴定,本研究对84份已知大白菜杂交种进行指纹图谱分析,最终确定了8对引物为大白菜品种纯度鉴定的核心引物,分别为Cnu-m477、Cnu-m098、Br ID90113、Nia-m022、Nia-m088、Sau-um044、Cnu-m461、Nia-m051。依照多态性和杂合率两个指标,确定Sau-um044和Nia-m088为本次研究的首选核心引物,并利用Sau-um044和Nia-m088进行鉴定,其中表现为杂合带型的共有81个品种(96.4%)。明确3对备选核心引物分别为:Cnu-m477、Cnu-m098、Br ID90113。根据特异性引物在纯度鉴定时的筛选标准,将特异引物可划分为两种类型:第一种类型是利用某一引物鉴定时,某品种的基因型表现唯一,则该引物可作为该品种的特异引物,在本研究中,表现为第一类特异引物共有13个品种,其中Sau-um044、Cnu-m477、Cnu-m461作为特异引物出现的次数最多,均为3个,而特异引物中没有Br ID90113、Nia-m022、Nia-m088;第二种类型是在特定品种中预测基因型频率低于1.19E-02(即1/84)的引物,作为特异引物。在本研究中,特异引物分别为:Sau-um044、Cnu-m477、Cnu-m461、Nia-m051。

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