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高粱GATA转录因子家族的鉴定和表达模式分析

文献类型: 中文期刊

作者: 姚茂星 1 ; 周光怡 1 ; 丁延庆 2 ; 李魁印 1 ; 任明见 1 ;

作者机构: 1.贵州大学农学院

2.贵州省农业科学院旱粮作物研究所

关键词: 高粱;GATA基因家族;转录因子;基因表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 010 期

页码: 3178-3187

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: GATA基因家族是真核生物中的一种转录因子,在动植物发育分化、生长增殖、分解凋亡以及植物响应环境变换等生物学过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学手段对高粱(Sorghum) GATA基因家族进行了全基因组分析,鉴定得到31个GATA基因家族成员,定位在9条染色体上(第7号染色体除外);亚细胞定位预测表明这些基因主要位于细胞核上;系统进化分析可将高粱GATA成员分为3个亚家族,大部分相似功能的已知植物GATA成员被聚在同一分枝上;表达模式分析表明,21个高粱GATA家族成员在6个高粱组织中表达具有特异性。本研究鉴定并分析了高粱GATA转录因子的生物学信息特征,为分子水平上高粱GATA家族基因的功能研究提供了一定的理论基础。

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