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基于BSA-seq技术挖掘糙皮侧耳抗螨候选基因

文献类型: 中文期刊

作者: 李辉平 1 ; 骆昕 1 ; 侯子强 2 ; 蒋宁 1 ; 林金盛 1 ; 侯立娟 1 ; 徐平 1 ; 马林 1 ; 曲绍轩 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

2.江苏大学生命科学学院

关键词: 糙皮侧耳(平菇);抗螨候选基因;群体分离分析法

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2022 年 006 期

页码: 1648-1656

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据前期不同糙皮侧耳菌株抗螨性差异调查结果,构建了糙皮侧耳孢子单核体群体,群体内479个菌株抗螨性呈正态分布。利用BSA-seq技术对高抗和高感混池进行SNP和InDel位点的欧氏距离关联分析,将抗螨性候选基因定位到一条染色体上,2个相邻候选区域总长度为1.75 Mb,内有基因605个,其中非同义突变基因353个,移码突变基因89个。经功能注释以及GO和KEGG通路富集等分析,发现26个候选基因参与了信号传导、防御过程和次级代谢相关通路,推测这些候选基因可能与糙皮侧耳抗螨性相关。

  • 相关文献

[1]利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点. 张云辉,张所兵,林静,汪迎节,方先文. 2014

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