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向日葵E3泛素连接酶基因克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张艳芳 1 ; 孙瑞芬 1 ; 郭树春 1 ; 于海峰 1 ; 石慧芹 2 ;

作者机构： 1.内蒙古农牧业科学院

2.内蒙古园艺研究院

关键词： 向日葵;E3泛素连接酶;基因克隆;序列分析;基因表达

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2016 年 36 卷 10 期

页码： 1933-1940

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 该研究从向日葵中克隆了E3泛素连接酶基因HERC2,并进行了生物信息学分析和不同胁迫条件的表达分析。序列分析表明,HERC2(登录号为KT832066)序列的CDS为1 608bp,编码535个氨基酸,预测其分子量131kD,等电点为5.03。HERC2编码的蛋白质为疏水性蛋白质,且为细胞质蛋白;亚细胞定位预测分析表明,向日葵HERC2可能定位在高尔基体中;该蛋白质有5个RCC1保守结构域。向日葵HERC2与已报道的其他植物同源蛋白有相似的保守区域,与醉蝶花亲缘关系最近,而与大豆和野生大豆的亲缘关系最远。与HERC2cDNA对应的gDNA(登录号为KT832067)的ORF长度为3 409bp,与cDNA编码序列比对结果表明,该gDNA由5个外显子和4个内含子组成。实时荧光定量PCR分析表明,向日葵HERC2基因表达受非生物胁迫调节,在不同器官及不同非生物胁迫下存在特异性表达差异。研究认为,HERC2基因应答逆境胁迫具有其特定的表达模式,研究结果为加强对HERC2的利用奠定了基础。

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