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芦笋两性花与雄花中发生可变剪接基因的差异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄玲 1 ; 李琼英 1 ; 韦树谷 1 ; 赖佳 1 ; 代顺冬 1 ; 张骞方 1 ; 曾华兰 1 ; 刘佳 1 ; 叶鹏盛 1 ;

作者机构: 1.四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所蔬菜种质与品种创新四川省重点实验室

关键词: 芦笋;两性花;雄花;性别分化;可变剪接

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2019 年 08 期

页码: 1503-1518

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 可变剪接在植物生长发育过程中起着非常重要的作用,它能使同一个mRNA前体生成多种不同的异构体和产生蛋白质多样性。利用RNA-seq测序技术分析芦笋两性花蕾与雄花蕾性别分化前期、中期、后期的可变剪接,从中发掘与两性花及雄花形成密切相关的特有可变剪接。研究结果显示,在所有试验材料中基因可变剪接均以3′端可变剪切位点(3S)和外显子跳跃(ES)类型为主。GO分析表明,两性花与雄花在3个时期均发生可变剪接的基因主要富集于代谢过程、生物合成以及物质结合相关GO条目中。通过GO和KEGG分析发现,两性花特有的可变剪接基因主要富集到代谢途径、核糖体蛋白等含氮化合物的生物合成代谢、过氧化物酶体、氧化磷酸化途径等,其中含氮化合物的生物合成代谢过程和过氧化物酶等抗氧化活性可能与两性花雌蕊的发育相关。雄花蕾特有的可变剪接基因主要富集到代谢途径、次生代谢产物的生物合成和脂肪酸生物合成等脂质代谢过程,其中脂肪酸生物合成等脂质代谢过程可能与雄花中雌蕊发育有关。

  • 相关文献

[1]石刁柏两性花与雄花的抗氧化酶活性及其相关基因可变剪接的差异分析. 黄玲,赖佳,韦树谷,代顺冬,李琼英,张骞方,曾华兰,刘佳,叶鹏盛. 2019

[2]川北生态区大棚芦笋栽培技术. 韦树谷,叶鹏盛,黄玲,张骞方,赖佳,曾华兰,何炼,蒋秋平,华丽霞,李琼英. 2016

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