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基于RNA-seq技术的茶树新梢组培褐变分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李解 1 ; 唐敏 1 ; 翟秀明 1 ; 杨娟 1 ; 侯渝嘉 1 ;

作者机构: 1.重庆市农业科学院茶叶研究所

关键词: 茶树(Camellia sinensis(L.)O.Ktze.);褐变;RNA-seq;组培

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 20 卷 003 期

页码: 943-950

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究褐变对于茶树组培转录水平的影响,以褐变前后的茶树组培新梢为研究材料,利用RNA-seq技术对样品进行转录组测序分析,筛选出1 753个差异表达基因,其中上调表达590个,下调表达1 163个.通过GO和KEGG数据库,对差异基因进行功能基因注释和富集分析,发现差异基因主要富集在糖代谢、应激与防御反应、植物激素信号传导、胁迫响应等代谢通路,表明褐变对于茶树新梢生长发育相关的基础代谢造成了损伤,褐化逆境抑制了相关基因的正常表达;同时,茶树新梢在响应褐变后,激活了Glyco_hydro_1、p450、AP2等与胁迫相关的转录因子高表达.本研究表明,褐变导致茶树组培大量基因被诱导或抑制表达,与胁迫响应相关的部分转录因子显著上调表达,这为解决褐变危害并获得茶树组培成功提供帮助.

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