文献类型: 中文期刊
作者: 刘静萍 1 ; 肖熙鸥 2 ; 周开兵 1 ; 柳凤 2 ; 张国辉 3 ; 普金安 4 ; 张翠英 4 ; 沐云松 4 ;
作者机构: 1.海南大学园艺学院
2.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所
3.华坪县有机晚熟芒果研究中心
4.新平彝族傣族自治县经济作物工作站
关键词: 杧果(Mangifera indica L.);SNP;PARMS;体系建立
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 021 期
页码: 7071-7077
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)是基于PCR反应的最新基因分型技术,构建杧果PARMS分型体系对杧果种质资源分类和品种选育均有重要意义。本研究以杧果基因组DNA为模板,对PARMS体系的反应体积、引物浓度、DNA浓度进行调整优化,以期建立最佳的杧果PARMS分型反应体系,同时利用48份杧果种质对优化体系进行了验证。结果表明:杧果PARMS分型反应体系的最佳体积为4μL:包含2μL 2×PARMS Master Mix,1μL DNA模板(稀释100倍),0.28μL特异性扩增引物混合物(100μmo L/L),0.72μL dd H2O。从可靠性和稳定性可以看出,优化的反应体系可将48份杧果种质资源显著分型。该反应体系的建立可在遗传多样性分析、指纹图谱构建、分子标记辅助育种等多领域对杧果展开研究。
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