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基于60K芯片的玉米回交群体精准背景选择策略

文献类型: 中文期刊

作者: 朱少喜 1 ; 张云龙 1 ; 赵怡锟 1 ; 许理文 1 ; 刘文彬 1 ; 徐翠 1 ; 葛建镕 1 ; 霍永学 1 ; 易红梅 1 ; 路运才 1 ; 王凤格 1 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院玉米研究中心/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室;黑龙江大学现代农业与生态环境学院

关键词: 玉米;Maize 6H-60K芯片;回交群体;背景选择

期刊名称: 玉米科学

ISSN: 1005-0906

年卷期: 2023 年 04 期

页码: 43-51

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用Maize 6H-60K芯片对京724/京92/京92的BC1代群体进行分子标记辅助背景选择,结合SNP数据特征和回交群体分离特征,开发出一套精准背景选择策略(ABSS:Accurate Background Selection Strategy)及相关算法。从统计结果中选取背景回复程度最高的一批单株作为下一代回交群体的亲本材料。基于Maize 6H-60K芯片分析和筛选产生的28 910个多态性位点,可以对727个样品的背景回复程度进行精细排序,样品背景回复率大部分分布在0.30~0.75(约占样品总数的94.1%),背景回复率在0.75及以上的样品比例为1.8%。通过分析回交群体重组交换规律以及背景回复率与株高的相关性,进一步验证Maize 6H-60K芯片数据和ABSS的准确性。利用Maize 6H-60K芯片结合ABSS可以精细选择背景回复程度高、重组交换频率相对较低的单株,显著提高背景选择效率,为设计玉米回交群体规模提供参考价值。

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