科研产出
不同菊芋品种块茎和根系分布特征分析
《中国瓜菜 》 2023
摘要：为探究不同菊芋品种块茎和根系分布规律，以红白7个菊芋品种为试验材料进行极稀种植，通过半径取样调查研究的方法，分析了不同菊芋品种块茎和根系分布特征。结果表明，不同品种间的块茎数量和根系质量无显著相关性，块茎数量、根系质量与块茎质量均呈正相关；不同品种块茎的区域分布规律不同，菊芋1号和菊芋3号单位面积块茎数量随着距离根系中心半径的增加呈下降的趋势，菊芋2号、菊芋4号、菊芋5号、菊芋6号和菊芋7号品种单位面积块茎数量随着距离根系中心半径的增加呈先下降后上升再下降的趋势；一年拓展距离中心半径均＜80 cm的品种为菊芋3号、菊芋5号和菊芋6号，一年拓展距离中心半径达100 cm的品种为菊芋1号、菊芋2号、菊芋4号和菊芋7号。菊芋5号单株块茎质量最大，为12 980.27 g·株-1；菊芋6号块茎分布最集中，为0～40 cm；菊芋4号块茎拓展距离远、块茎数量多，块茎数量达415.67个·株-1。
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基于第二代转录组、第三代全长转录组测序条件下草石蚕基因表达特性的初步研究
《宁夏农林科技 》 2023
摘要：以宁夏贺兰县地方草石蚕（Stachys sieboldii）品种为试材，探讨应用第三代测序技术获得草石蚕全长转录本信息，应用第二代测序技术获得3个不同发育阶段草石蚕叶片和块茎的转录组信息，对测序结果进行转录组水平分析，筛选特有差异基因，并进行GO和KEGG富集分析，开展草石蚕基因表达特性的初步研究。结果表明，第三代测序后Polymerase read的数据量为50.82 G,FLNC序列的reads数为525 593个转录本；在KEGG等7大数据库的基因功能注释中均注释成功的转录本数目为6 857个，至少有1个数据库注释成功的转录本数目为14 078个；与NR数据库比对注释后，草石蚕与同为唇形目的芝麻（Sesamum indicum）基因序列相似性最高，相似基因个数为9 149个；与GO数据库比对注释后，生物学过程、细胞成分与分子功能中注释到基因个数最多的分别是新陈代谢过程5 093个、细胞2 004个、键联结合6 645个；与KEGG数据库比对注释后，在细胞转化、环境信息处理、遗传信息处理、新陈代谢和有机系统功能中注释到基因数最多的分别是运输和分解代谢409个、信号传导729个、转化626个、碳水化合物代谢601个、内分泌系统297个。第二代测序后，ZLZ＿2＿S＿3和ZLZ＿2＿S＿1差异基因比较中的上调基因数最高，为2 303个；ZLZ＿2＿L＿3和ZLZ＿2＿S＿3差异比较中的下调基因数最高，为2 033个。叶片3个时期ZLZ＿2＿L＿1、ZLZ＿2＿L＿2与ZLZ＿2＿L＿3组合之间比较差异基因总数为13 610个，共有差异基因数为10 203个；ZLZ＿2＿L＿3独有的差异基因数最多，为437个。块茎3个时期ZLZ＿2＿S＿1、ZLZ＿2＿S＿2与ZLZ＿2＿S＿3的组合之间比较差异基因总数为13 732个，共有的差异基因数为11 370个，ZLZ＿2＿S＿3独有的差异基因数最多，为412个。ZLZ＿2＿S＿3、ZLZ＿2＿S＿2聚类图显示高表达基因的数值范围主要为0～2，显著高于其他处理，可以聚为一类。3个不同时期叶片的差异基因主要集中在光合作用生物碳固定、内质网中蛋白质加工以及乙醛酸和二羧酸代谢等通路上；3个不同时期块茎的差异基因主要集中在淀粉和蔗糖代谢、糖解与糖代谢合成等通路上。以上结论将为今后研究草石蚕的生物学特性、阐明特有表型差异机制提供参考，为提升草石蚕的基础理论研究水平提供技术支撑。
关键词： 第二代转录组 第三代全长转录组 草石蚕 基因表达特性
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放牧与舍饲模式对滩羊肉品质、瘤胃环境及菌群结构的影响
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】旨在研究放牧与舍饲2种饲养模式对滩羊肉品质、瘤胃菌群的影响。【方法】试验选取健康、体况接近[（20.20±2.10） kg]的盐池滩羊公羔32只，随机分为舍饲组（C组，饲喂全混合日粮）和放牧组（G组，采食放牧草地）,每组16只。饲喂87 d后屠宰，测定其背最长肌肉品质，同时采集新鲜瘤胃液进行高通量测序，分析放牧与舍饲对滩羊瘤胃微生物多样性及菌群结构的影响。试验预试期7 d,正试期80 d。【结果】舍饲滩羊肌内脂肪、熟肉率、pH（45 min）、背最长肌肉色L与肉色b显著高于放牧滩羊（P＜0.05）,而放牧羊肉pH（24 h）和肉色a显著高于舍饲羊肉（P＜0.05）。瘤胃发酵参数分析发现，放牧滩羊瘤胃pH、异丁酸、异戊酸、乙酸/丙酸显著高于舍饲滩羊（P＜0.05）,而2组的氨态氮、乙酸、丙酸、丁酸、戊酸无显著差异（P＞0.05）。2组检测到OTU总数为2106个，其中放牧组和舍饲组分别为1869和1445个，特有OTU数分别为661和237个，分别占OTU总数的31.38%和11.25%。放牧组瘤胃菌群中观测到的物种数、Shannon指数、Chao1指数、ACE指数均显著高于舍饲组（P＜0.05）,而2组Simpson指数差异不显著（P＞0.05）。2组滩羊瘤胃中优势菌门主要为拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）,拟杆菌门在舍饲滩羊样本中的相对丰度为81.38%,高于放牧组的52.96%（P＜0.05）,而厚壁菌门在舍饲组中相对丰度为15.88%,低于放牧组的37.42%（P＜0.05）;舍饲组变形菌门相对丰度为1.14%,低于放牧组的5.56%（P＜0.05）。在属水平上，优势菌属主要为未鉴定的普雷沃氏菌科（unidentified＿Prevotellaceae）、未鉴定的拟杆菌科目（unidentified＿Bacteroidales）、未鉴定的瘤胃菌科（unidentified＿Ruminococcaceae）,其中未鉴定的普雷沃氏菌科占比最高，放牧组相对丰度为14.74%,高于舍饲组的4.35%（P＜0.05）。放牧组中未鉴定的拟杆菌科目相对丰度为3.63%,稍高于舍饲组的3.32%（P＞0.05）。放牧组中未鉴定的瘤胃菌科相对丰度为6.49%,高于舍饲组的2.11%（P＜0.05）。【结论】饲养方式可影响滩羊肉品质及瘤胃内环境，其中舍饲有利于脂肪沉积，改善羊肉嫩度，而放牧可提高瘤胃菌群多样性，有利于瘤胃健康。
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宁夏部分地区奶牛贾第鞭毛虫分子流行病学调查
《黑龙江畜牧兽医 》 2023 北大核心
摘要：为了明确宁夏地区奶牛贾第鞭毛虫的优势基因型及其流行特征，试验首先于宁夏地区10个规模化奶牛养殖场采集880份奶牛粪便样品，针对贾第鞭毛虫保守基因——β-贾第素（β-giardin, βg）基因序列设计引物，然后以提取的粪便样品全基因组DNA为模板进行巢式PCR,将PCR产物的测序结果进行BLAST比对分析，鉴定贾第鞭毛虫的基因型，并建立系统进化树，最后对宁夏地区不同城市、不同月龄及腹泻和非腹泻奶牛粪便样品的感染阳性率和基因型进行统计。结果表明：880份粪便样品中，有145份样品扩增到大小为510 bp的条带，贾第鞭毛虫感染阳性率为16.5%（145/880）,其中集聚体A的占比为1.4%（2/145）,集聚体E的占比为98.6%（143/145）;所有集聚体A的βg基因为1种序列（已上传至GenBank,登录号为OQ101261 1NX）,所有集聚体E的βg基因为4种序列（已上传至GenBank,登录号分别为OQ101262 2NX、OQ101263 3NX、OQ101264 4NX和OQ101265 5NX）;OQ101261 1NX（奶牛）与MK5773339.1（藏牛）、MF497409.1（麝香鹿）和LC437420.1（犬）等在同一分支上；OQ101262 2NX（奶牛）、OQ101263 3NX（奶牛）、OQ101264 4NX（奶牛）与MK862313.1（马）、KR0755939.1（绵羊）、MK610388.1（滩羊）等在同一分支上；OQ101265 5NX（奶牛）与KJ188047.1（奶牛）、KJ188056.1（奶牛）、MK5773337.1（藏牛）在同一分支上。宁夏地区四个城市奶牛贾第鞭毛虫感染阳性率表现为中卫市（50.0%,8/16）＞银川市（16.3%,126/772）＞吴忠市（14.3%, 9/63）＞石嘴山市（6.9%, 2/29）;仅在银川市同时检测出集聚体A（1.6%,2/126）和集聚体E（98.4%,124/126）,在中卫市、石嘴山市和吴忠市均仅检测出集聚体E;不同月龄奶牛贾第鞭毛虫感染阳性率表现为3～4月龄（26.5%,30/113）＞0～2月龄（23.3%,53/227）＞5～7月龄（17.4%,49/282）＞12月龄以上（6.9%,13/189）＞8～12月龄（0,0/69）,仅在5～7月龄奶牛粪便中同时检测出集聚体A（4.1%,2/49）和集聚体E（95.9%,47/49）,其他月龄段均仅检测出集聚体E;腹泻样品中贾第鞭毛虫感染阳性率为23.6%（37/157）,非腹泻样品中贾第鞭毛虫感染阳性率为14.9%（108/723）,腹泻样品中集聚体A和集聚体E的占比分别为2.7%（1/37）和97.3%（36/37）,非腹泻样品中集聚体A和集聚体E的占比分别为0.9%（1/108）和99.1%（107/108）。说明宁夏地区奶牛存在第鞭毛虫感染，集聚体E为优势基因型。
关键词： 宁夏地区 贾第鞭毛虫 奶牛 β-贾第素 巢式PCR 粪便样品
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不同品种肉牛肌内脂肪沉积相关基因比较研究
《动物营养学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在通过分析西门塔尔牛和安格斯牛背最长肌肉质特性及转录组测序表达谱，筛选肌内脂肪沉积相关基因，为其脂肪沉积机制研究提供参考依据。试验选择饲养管理条件一致、体重[（700±10） kg]相近的健康西门塔尔和安格斯公牛各3头，屠宰后采集背最长肌进行肉品质、氨基酸和脂肪酸组成测定及转录组测序。结果表明：1)安格斯牛肌内脂肪含量和系水力极显著高于西门塔尔（P＜0.01），而肌纤维直径显著低于西门塔尔牛（P＜0.05）；安格斯牛肌肉酪氨酸含量极显著高于西门塔尔牛（P＜0.01），肌肉精氨酸含量极显著低于西门塔尔牛（P＜0.01）;2种牛之间肌肉脂肪酸含量无显著差异（P＞0.05）。2)转录组测序分析显示，与安格斯牛相比，西门塔尔牛共有1 214个候选基因在肌肉组织中差异表达{校正后的P值（Padj）＜0.05及|log2[差异倍数（FC）]|＞1}，其中上调基因736个，下调基因478个。基因本体（GO）功能富集分析注释到43个条目，其中生物过程20个，细胞组分15个，分子功能8个。京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析显著富集到心肌收缩（cardiac muscle contraction）和逆行内源性大麻素信号（retrograde endocannabinoid signaling）等脂肪沉积相关通路中，结合GeneCards功能查询获得3个与脂肪沉积相关的基因——淀粉样前体蛋白（APP）、原肌球蛋白2（TPM2）和钙电压门控通道亚基α1 S（CACNA1S）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）验证结果与转录组测序结果一致，即安格斯牛肌肉CACNA1S和TPM2表达量显著高于西门塔尔牛（P＜0.05），表明其对脂肪沉积有促进作用；安格斯牛肌肉APP表达量较西门塔尔牛呈降低趋势（P＞0.05），表明其对脂肪沉积有负调控作用。综上可知，安格斯牛肌内脂肪沉积能力较强，肉品质较好；转录组测序发现了3个与肉牛肌内脂肪沉积相关的候选基因，为肉牛肌内脂肪沉积调控机制研究提供了参考。
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不同药剂和包装处理对苹果贮藏品质的影响
《宁夏农林科技 》 2023
摘要：为了延长苹果的贮藏期，提高其品质，改进苹果贮藏技术，开展采后不同药剂和包装方式处理对苹果贮藏期间品质影响的研究。采摘成熟度一致、大小均匀的新红星、国光、秦冠、富士苹果，采用品质评价方法对各试验处理的苹果贮藏效果进行对比，明确各品种苹果最佳使用药剂。结果表明，多菌灵配合CaCl2处理可有效保持富士、国光、秦冠苹果品质，保鲜效果更好；装袋封口的包装处理方式较好地保存了果实的风味，贮藏效果最佳，在0～2℃条件下贮藏，可保鲜6个月。研究不同药剂和包装处理对苹果贮藏品质的影响旨在为新红星、国光、秦冠、富士苹果的采后贮藏及品质保障提供理论指导和技术支撑。
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牛分枝杆菌肉芽肿形成机理的研究进展
《畜牧与兽医 》 2023 北大核心
摘要：牛结核病(bovine tuberculosis, bTB)是由牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起的一种人兽共患的慢性传染病。bTB的发展和转归是宿主的免疫系统和牛分枝杆菌相互斗争的结果，这种斗争最基本和最主要的病理特征之一是形成肉芽肿。因此，阐明肉芽肿的形态特点及参与肉芽肿形成的因素，揭示肉芽肿形成的动态过程，对于了解结核病的发生发展规律，以及研发新的抗结核药物具有重大意义。本文对牛结核肉芽肿的特点、功能以及参与牛结核肉芽肿形成的各种因素进行了综述。
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樱桃番茄新品种'宁樱2号'
《园艺学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：‘宁樱2号’是以1192为母本，411为父本选育的樱桃番茄一代杂交种，无限生长型，生长势强，成熟早，多歧花序，单花序坐果数12～25个，果实高圆形，成熟果橘黄色，果肉浅黄，单果质量20 g左右，可溶性固形物含量为10.17%，番茄红素含量为19.7 mg·kg-1，维生素C含量为451.1 mg·kg-1，心室数2个，口感甜，风味浓，坐果能力强。抗叶霉病、灰叶斑、晚疫病、疮痂病、青枯病、黄萎病。适宜宁夏地区露地栽培，冬春茬温室和早春、秋延大拱棚栽培，产量达63 000 kg·hm-2。
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马铃薯StKNOX1基因的克隆及表达分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：KNOX基因是一类转录调控因子，其和植物的生长发育密切相关。为了探讨同源异型盒（KNOX）基因在马铃薯（Solanum tuberosum L.）块茎发育中的作用，采用RT-PCR和RACE技术，克隆了1个KNOX同源基因，且根据属性情况命名为StKNOX1，其属于KNOX家族I类蛋白，编码含344个氨基酸的蛋白，包含KNOX1、KNOX2、ELK等结构域。根据相关生物信息研究结果，该基因编码的蛋白与番茄中KNOX1的一致性最高（93.7%）。StKNOX1基因在马铃薯的各组织器官中均有表达，在根和块茎中的表达水平显著高于其他部位的表达水平。本研究将为进一步开展基因功能研究奠定理论基础，为马铃薯生物技术育种提供基因资源。
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鸡滑液囊支原体病防治研究进展
《中国畜禽种业 》 2023
摘要：鸡滑液囊支原体病是当前我国禽类养殖业影响比较大的传染病，并且容易与新城疫、大肠杆菌等其他病原混合或继发感染，对养殖业造成极大的经济损失。该文主要介绍了鸡滑液囊支原体病的病原学、流行病学、致病机制、诊断、防治措施及疫苗研制等方面的研究进展，以期为今后鸡滑液囊支原体病的研究提供参考。
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